杭州碳硅智慧科技发展有限公司刘丽君获国家专利权
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龙图腾网获悉杭州碳硅智慧科技发展有限公司申请的专利一种衣壳蛋白序列生成模型的训练方法及装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116525011B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310333553.8,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权一种衣壳蛋白序列生成模型的训练方法及装置是由刘丽君;宋剑飞;邓亚峰;施慧设计研发完成,并于2023-03-27向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种衣壳蛋白序列生成模型的训练方法及装置在说明书摘要公布了:本申请实施例提供了一种衣壳蛋白序列生成模型的训练方法及装置。所述方法包括:获取训练数据,所述训练数据为在蛋白质分子的选定区域内具有指定衣壳功能的序列集合;对所述训练数据进行数据增强处理,得到模型训练数据;基于设定加噪处理方式对所述模型训练数据进行不同时刻的加噪处理,得到在不同时刻的加噪训练数据;根据所述加噪训练数据和指定生成路径下的损失函数对待训练衣壳蛋白序列生成模型进行训练,得到所述指定衣壳功能的在所述指定生成路径下的衣壳蛋白序列生成模型。本申请实施例可以生成大量衣壳所需功能的衣壳蛋白序列,产生的衣壳蛋白序列可用序列的占比较高,同时,找到的可用的序列数量要比随机突变找到的序列数量大很多。
本发明授权一种衣壳蛋白序列生成模型的训练方法及装置在权利要求书中公布了:1.一种衣壳蛋白序列生成模型的训练方法,其特征在于,所述方法包括: 获取训练数据,所述训练数据为在蛋白质分子的选定区域内具有指定衣壳功能的序列集合; 对所述训练数据进行数据增强处理,得到模型训练数据; 基于设定加噪处理方式对所述模型训练数据进行不同时刻的加噪处理,得到在不同时刻的加噪训练数据; 根据所述加噪训练数据和指定生成路径下的损失函数对待训练衣壳蛋白序列生成模型进行训练,得到所述指定衣壳功能的在所述指定生成路径下的衣壳蛋白序列生成模型; 其中,所述设定加噪处理方式包括:离散型加噪方式和连续型加噪方式中的任一种; 在所述设定加噪处理方式为离散型加噪方式时, 所述基于设定加噪处理方式对所述模型训练数据进行不同时刻的加噪处理,得到在不同时刻的加噪训练数据,包括: 根据预先定义的在不同时刻的转移概率矩阵对所述模型训练数据进行加噪处理,得到所述模型训练数据对应的在不同时刻的加噪训练数据; 其中,在所述指定生成路径为预测未加噪序列的路径时, 所述根据所述加噪训练数据和指定生成路径下的损失函数对待训练衣壳蛋白序列生成模型进行训练,得到所述指定衣壳功能的在所述指定生成路径下的衣壳蛋白序列生成模型,包括: 根据所述设定加噪处理方式和所述预测未加噪序列的路径,确定第二损失函数; 基于所述加噪训练数据和所述第二损失函数对所述待训练衣壳蛋白序列生成模型进行训练,得到所述指定衣壳功能的在所述预测未加噪序列的路径下的衣壳蛋白序列生成模型。
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