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  • 本公开提供一种多价蛋白质动力学性质预测方法及相关产品。该多价蛋白质动力学性质预测方法的一具体实施方式即通过在模拟多价蛋白质与细胞膜表面的抗原结合的微观状态浓度变化速率的过程中,采用所结合抗原的有效浓度,而不是所结合抗原的客观浓度,进而可以提...
  • 本发明公开本发明提供一种基于统一消息的时序特征融合用于药物‑靶点结合亲和力预测分类方法,属于医疗预测领域。本发明的方法包括以下步骤:通过RDKit将药物的SMILES序列转换为子图形式,而蛋白质序列则用one‑hot编码表示;通过特定的特征...
  • 本发明首次提出了一种基于网络的鉴定疾病靶点的方法ComplexDnet。该方法在WGCNA结果的基础上,构建蛋白互作网络,并进一步对网络进行结构关键性分析、鲁棒性分析和功能一致性分析,分别获得三种得分。根据上述三种得分构建了一个综合得分算法...
  • 本发明公开了一种蛋白质和RNA结合亲和力的预测方法及系统,属于生物信息学技术领域。该方法包括以下步骤:首先获取蛋白质和RNA的原始氨基酸序列及核苷酸序列的高维嵌入向量和三维结构;利用Graph Transformer模型构建蛋白质图并整合序...
  • 本公开的实施例公开了基于迭代最近点的抗原抗体结合构象优化方法与装置。该方法的一具体实施方式包括:得到粗粒化抗体文件和粗粒化抗原文件;对抗原结构文件和抗体结构文件进行表面残基提取,得到抗原表面残基信息集和抗体表面残基信息集;生成抗体结合区域残...
  • 本发明涉及帕利哌酮代谢效率评估技术领域,尤其涉及一种基于CYP2D6基因与环境因素的帕利哌酮代谢效率评估系统。该系统通过将获取到的历史的数据信息进行预处理,能够获取更加有效的数据信息,从而利用该数据信息更加有效的训练模型;同时,基于预处理后...
  • 本发明公开了一种基于虚拟原子和距离层次学习的蛋白质功能预测方法,包括数据预处理,虚拟原子初始化,定义关系集,所有原子经过嵌入层得到初始隐藏状态,采样一个均匀分布作为关系聚合的权重概率系数,根据权重系数采用基于关系集的消息聚合网络先后进行真实...
  • 本发明公开了基于低深度测序数据检测目的表型相关基因或候选基因的计算机装置、方法及应用。本发明使用代表每个SSP基因在泛基因组水平上的29‑mer序列,以揭示不同小麦品种和现代栽培品种之间尚未发掘的基因多样性。基于k‑mer的全基因组关联研究...
  • 本发明公开了一种基于深度学习的病毒基因组数据分析与预测系统,涉及数据管理技术领域,通过深度学习模型模块利用卷积神经网络提取基因组局部特征并实现分类与变异检测;鲁棒性评估模块通过分析新突变测试数据集,量化模型在新突变中的性能波动;置信度分析模...
  • 本发明提供用于推测人亲缘关系等级的20838个SNP位点组合及其应用。本发明提供一种用于推测人亲缘关系等级的SNP位点组合,包括20838个SNP位点。基于上述20838个SNP位点组合,本发明建立了平均矩量法这一系谱关系推断算法,用于法医...
  • 本发明公开了一种基于IAPP的计算机辅助药物筛选方法、系统和设备。本申请首次在宿主体内证实SARS‑CoV‑2S/N蛋白直接结合IAPP并促进其病理性聚集。首次发现新冠病毒感染诱发胰岛微环境补体系统激活,促炎因子释放与内质网应激协同加剧β细...
  • 本发明涉及生物医学技术领域,具体涉及一种基于糖代谢和乳酸代谢相关基因的肝癌分子亚型分型和预后模型构建方法及其应用。本发明首次基于糖代谢基因和乳酸代谢基因的协同调控网络构建了肝癌亚型的分型和预后模型,构建的肝癌分子亚型分型包括包括Cluste...
  • 本申请涉及生物信息学与分子生物学技术领域,公开了一种基于长链非编码RNA多组学整合分析的因子分析系统。系统包括:多组学数据获取模块,配置为获取包含长链非编码RNA相关的多模态组学数据;数据预处理模块,配置为对多模态组学数据进行预处理,生成统...
  • 本发明涉及生物信息学技术领域,公开一种针对三代全长转录本测序数据寻找碱基突变的方法、系统、设备及介质,本发明通过直接处理三代全长转录本测序数据,将碱基突变精准定位至特定转录本,准确解析多个突变在同一转录本上的共现关系,有效克服二代短读长测序...
  • 本发明公开了一种基于条件变分自编码器的空转基因表达填补方法,包括:设计用于单细胞转录组数据和空间转录组数据联合分析的统一框架,获取单细胞转录组测序表达谱数据、空间转录组表达数据以及用于编码组织内局部邻域协方差的COVET矩阵;通过注意力增强...
  • 本发明涉及生物信息领域,尤其涉及一种基于调控通路扰动分析的基因异常调控检测方法,该方法包括:采集生物样本与通路结构数据;通过基因动态行为与通路上下文信息获取加权优化的通路扰动评分;通过差异表达显著性与样本间一致性获取基因动态影响力因子;通过...
  • 本发明属于基因测序技术领域,具体涉及一种基于单拷贝基因序列的杨属杂交种亲本来源鉴定方法、系统、设备及介质,该方法首先构建包含杨属五大派系参考物种的单拷贝基因序列参考库,每条序列包含基因编码区及其上下游延伸序列;然后获取待测样本的二代测序数据...
  • 本发明公开了基于低深度测序数据进行遗传图谱构建或基因定位的装置和方法及应用。本发明利用重测序技术对每一个作图群体品系进行约0.1×的超低深度测序,对亲本进行较高深度测序,然后基于测序数据检测追溯作图群体每个品系的全基因组窗口中双亲单倍型(包...
  • 本发明公开了一种酶辅助的多肽片段无标记序列读出方法,包括以下步骤:利用纳米孔道分别检测长度差异和氨基酸差异的多肽的阻断离子流信号构建长度差异、氨基酸差异的多肽数据库;基于多肽数据库构建并训练分类模型;利用纳米孔道检测目标多肽的酶切产物得到相...
  • 本发明属于肿瘤治疗技术领域,具体涉及卵巢癌细胞生长、肿瘤形成与免疫逃逸相关基因的CRISPR文库筛选方法。所述sgRNA文库包含靶向选自MusCK文库中80个基因的sgRNA。本发明使用了靶向4, 922个与肿瘤的起始、进展和免疫调节有关基...
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