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  • 本发明提供一种细胞特异性转录因子调控网络分析方法及可视化平台, 涉及生物信息学技术领域, 所述方法包括:基于转录因子结合基序数据库, 通过GRNBoost2‑cisTarget‑AUCell‑CellGRN工作流程构建基因调控网络;结合所述...
  • 本发明适用于生物信息学技术领域, 提供了基于微生物毒力因子功能基因集的机器学习分类方法。该方法从宏基因组和宏转录组数据中提取毒力因子相关信息, 经质量控制、匹配定量后, 结合VFDB数据库中14个毒力因子功能类, 通过单样本基因集富集分析计...
  • 本发明公开了一种基于蛋白质语言模型与多模态神经网络的通用HLA抗原呈递预测方法, 首先, 从免疫表位数据库提取已验证的HLA结合肽段序列, 结合蛋白质数据库生成等量的非表位肽段序列, 构建HLA‑I类与HLA‑II类的平衡数据集。随后, 利...
  • 本公开实施例公开了一种基于人工智能的生命组学研究方法和装置, 其中, 方法包括:根据用户与系统的智能交互, 对项目进行预处理, 生成标准化数据。同时对大语言模型进行迁移学习, 构建生命科学大语言模型。根据标准化数据, 采用生命科学大语言模型...
  • 本发明公开了一种基于深度学习的基因组变异过滤方法和系统, 在预处理阶段, 采用五种不同的特征工程方法来生成数百种候选特征, 基于基因组数据的现有特征, 增强模型的学习和泛化能力。设计机器学习模型LightGBM筛选原始特征和候选特征的集合,...
  • 本发明为一种醛类消毒剂杀菌效果实时监测方法及系统, 涉及过程监控技术领域, 包括采集微生物电化学响应信号, 获取时域阻抗模值、相位角及环境参数时序。对阻抗模值时序进行小波包分解, 提取细胞膜通透性特征频带信号, 生成频域包络谱时序。四类时序...
  • 本发明公开了干细胞培养基成分自适应优化系统及方法, 涉及生物工程技术领域, 用于精准调节培养基成分并维持多能性。系统包括代谢失衡诊断模块, 通过非侵入式光谱与分泌组分析捕获代谢物失衡信号并识别毒性物质, 输出代谢冲突的特征向量;通路重构模块...
  • 本发明提出一种基于曼巴模型与半监督学习的RNA序列分类方法, 属于生物信息学领域。首先, 对RNA序列提取多尺度稀疏特征, 并通过编码器网络将高维特征压缩至低维潜在空间向量, 同时进行L2归一化以增强特征可分性。其次, 在残差结构中引入基于...
  • 本发明提供了一种构建功能基因蛋白识别模型的方法及装置, 该方法包括:获取功能基因蛋白参考序列;根据获取的功能基因蛋白参考序列, 筛选与参考序列同源的序列, 生成用于构建模型的序列集;将生成的所述序列集随机划分为训练集和测试集, 根据所述训练...
  • 本发明基于深度学习技术在生物酶中的应用, 结合GPT模型, 提出了一种预测酶的功能的算法。包括:序列嵌入、掩码多头自注意力机制提取序列特征。首先从公共数据库获取酶序列数据, 划分预训练与微调数据集;使用酶序列自监督预训练GPT模型, 学习序...
  • 本发明提出了一种融合多组学数据的生物标志物识别方法, 包括数据清洗、归一化、整合、特征提取与选择等步骤。数据清洗去除噪声和校正偏差, 归一化缩放和标准化数据分布, 整合关联不同组学数据并进行对齐处理;特征提取基于统计、频域和图像分析, 特征...
  • 本发明公开了一种基于背景噪音模型的ctDNA去噪背景参考系统, 涉及分子诊断与生物信息学技术领域, 包括数据预处理模块、背景噪音模型构建模块、集成线性学习模型模块、去噪与变异识别模块、结果验证与输出模块。本发明通过提供完整系统架构, 覆盖从...
  • 本发明的实施例提供了一种蛋白质DDG预测模型优化方法、蛋白质DDG预测方法及相关装置, 涉及生物信息数据处理技术领域。该方法包括:获取野生型蛋白质三维结构数据、突变体蛋白质三维结构数据以及第一DDG值。分别将野生型蛋白质三维结构数据与突变体...
  • 本发明公开了一种基于全基因组选择青鱼生长性状最佳预测体系及其构建方法和应用, 由最佳GS统计模型GBLUP模型和数量为12000的最佳SNP基因型位点集组成, 构建方法包括:对499尾青鱼进行基因组重测序和基因分型, 获得237730个高质...
  • 本公开提供一种生存期预测模型的训练方法、生存期预测方法及装置, 所述生存期预测模型的训练方法包括:获取群体训练数据和空间训练数据。分别根据群体训练数据和空间训练数据对待训练的生存期预测模型进行训练, 得到训练完成的生存期预测模型。通过联合利...
  • 本发明提出基于数据插值和细胞类型反卷积进行空间域识别的方法, 属于生物信息学技术领域, 本发明为解决传统方法在低分辨率空间转录组数据中无法利用相邻点间空隙信息和未能充分整合细胞类型在组织空间结构层面的先验信息的问题, 包括:获取空间转录组数...
  • 本发明公开了一种基于微生物群落的排水系统外水来源预测方法、存储介质及设备, 包括:收集排水系统进水、河水、地下水以及排水系统周边居民小区生活污水的水质参数、环境因子、微生物类型和代谢物浓度;将收集的微生物类型和代谢物浓度进行微生物群落时空解...
  • 本发明公开了一种高分泌水平信号肽的设计方法, 主要包括以下步骤:构建信号肽分泌目标领域数据集和源领域数据集;实施迁移学习, 训练出预测信号肽分泌水平的分类和回归模型;基于目标领域数据集信号肽序列的氨基酸种类‑位置概率分布, 建立信号肽生成器...
  • 基于改进自注意力与Mamba双模块的不同长度基因组序列编码方法, 它涉及一种不同长度基因组序列编码方法。本发明为了解决现有技术中基因组序列无法合理输入至神经网络模型的问题。本发明在数据处理序列特征提取过程, 提取不同长度基因组序列的kmer...
  • 本发明提供了微生物组数据驱动的土壤肥力预测方法及系统, 涉及数据预测技术领域, 包括:配置土壤采样矩阵;执行H频次的间歇性分层采样, 并执行微生物组数据测定, 得到微生物群落时序矩阵;进行肥力养分转换处理后, 执行动态演变规律捕捉, 预测输...
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