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  • 本发明涉及生物信息学技术领域,且公开了基于深度学习的猪全基因组低密度 SNP 芯片开发方法,包括以下步骤:(1)进行 50K 芯片测序,以检测不同品种群体的基因型;(2)对群体样本的基因型和表型数据进行系统的整理和统计分析;(3)对群体检测...
  • 本发明公开一种多基因突变的肿瘤新抗原多肽算法,该发生突变的抗原靶点,具体位点是基因APRT p.E141V, KCTD10 p.Y172N, PABPC1 p.L218V, ADAM28 p.C315G, ARF3 p.G6V, KLHL2...
  • 本申请公开了一种单细胞转录数据分析方法、装置及非易失性存储介质。其中,该方法包括:采用各个备选模型对应的数据预处理方式对初始数据进行处理,得到各个备选模型所需的输入数据;依据各个备选模型对应的加载类来读取各个备选模型的模型配置信息,从而加载...
  • 本申请涉及生物信息学领域。具体地,本申请涉及基于单细胞转录组数据推测可变剪接功能的方法和装置。该方法包括:确定数据集中每个基因在细胞中的可变剪接模式;确定可变剪接模式和每个基因的基因表达之间的关联关系;根据可变剪接模式和基因表达之间的关联关...
  • 本发明公开了一种毛细管长片段测序数据质量修正方法,针对现有技术中峰边界识别僵化、质量值校正维度单一、长片段测序适应性差及缺乏可视化验证的核心缺陷,通过动态识别峰边界解决峰形参数计算不准确的问题,通过整合半高宽、对称性、干扰程度等多维度峰形特...
  • 本发明公开了多组学数据整合的肿瘤早期诊断分子标志物筛选方法,属于生物医学技术领域。该方法包括样本收集与多组学数据获取、数据预处理与标准化、多组学数据分层整合、核心标志物筛选及多维度递进式验证五个步骤。通过“功能导向‑调控网络引导‑异质性适配...
  • 本发明属于深度学习技术领域,具体涉及基于深度学习的可解释DNA序列基序提取与可视化方法,基于数据集AGCT背景构造的基线输入与DeepLIFT归因相结合的motif提取方法;将目标motif长度参数化为归一化截止频率并通过可调低通滤波实现长...
  • 本发明涉及品种鉴定技术领域,尤其涉及山羊品种鉴定芯片位点筛选系统及方法,该方法的步骤包括:获取监测区域内目标山羊品种和参照山羊品种的性状特征数据,同步获取监测区域内的环境特征数据;基于性状特征数据分析不同性状特征的生长趋势,评估目标山羊品种...
  • 本发明公开了育种群体多性状综合选择指数计算平台,涉及作物遗传育种技术领域,包括:数据获取模块收集实时表型数据流与历史年龄序列数据。模型拟合模块利用历史数据拟合初始年龄动态模型;偏离计算模块通过计算标准化残差,量化实时数据与模型预测的偏离程度...
  • 本发明属于生物信息技术领域,公开了一种植物着丝粒识别与边界界定方法,具体步骤包括:对CENH3 ChIP‑seq原始测序数据进行质量控制;将质控后的reads比对至目标植物参考基因组,文件转换后按预设窗口计算每个bin的平均覆盖度或ChIP...
  • 本发明公开了一种基于全长转录组测序的肿瘤新抗原预测方法、系统、电子设备及存储介质,包括:对肿瘤组织和正常对照组织进行全长转录组测序,并进行转录注释,得到肿瘤特异性转录本集合;对肿瘤特异性转录本进行单碱基分辨率分析,识别肿瘤细胞的突变信息;排...
  • 本发明涉及生物检测技术领域,公开了基于DNA检测的目标病原细菌免疫抗体检测方法。该方法包括获取待测生物样本的目标病原细菌DNA序列数据和免疫抗体蛋白表达量数据;对目标病原细菌DNA序列数据进行突变位点扫描,识别高频突变区域边界并计算序列突变...
  • 本发明公开了一种基于并行计算与多目标优化的大规模引物池筛选系统及方法,属于生物信息学与分子生物学技术领域。所述系统包括:候选引物生成模块、高速生物学特性分析引擎以及多目标协同优化模块。方法包括:生成初始候选引物池;利用基于k‑mer索引的快...
  • 本发明公开了基于机器学习优化的鸟类鉴定通用引物设计方法和应用,该方法以DNA条形码技术为基础,该方法通过多重比对结合Shannon熵判定保守碱基,提高获取保守序列的准确性;建立涵盖覆盖度、Tm值、互作程度、简并碱基数量及poly结构的多维度...
  • 本申请公开了一种抗体人源化方法、系统、设备及程序产品,方法包括:通过预先训练的V基因序列特征提取模型对期望V基因氨基酸序列进行特征提取处理,得到V基因序列特征;对待人源化的抗体氨基酸序列进行区域固定处理,得到初始化序列;将初始化序列和V基因...
  • 本申请公开了一种抗体语言模型训练方法、抗体序列预测方法及其装置,方法包括:获取训练样本集,所述训练样本集中的训练样本通过预先构建的抗体多元编码词汇表生成得到;对所述训练样本集中的训练样本进行结构化语料构建处理,得到训练语料数据集;根据所述训...
  • 本发明属于代谢产物预测技术领域,具体涉及一种基于三维异构网络的药物代谢产物预测方法。本发明解决了药物代谢产物预测中关键的代谢酶信息缺失的问题,并通过计算化学结构相似性和蛋白质序列之间的相似性等将药物分子、代谢酶分子、代谢产物分子等的生化信息...
  • 本发明公开了一种基于抗体特异性语言模型的B细胞亚群预测方法,属于生物医学领域。本方法通过使用Transformer模型编码BCR序列,并使用对比学习任务和掩码语言建模任务自动学习BCR序列中的抗体编码模式,实现B细胞亚群的准确预测。构建本方...
  • 本发明公开了一种预测泛素连接酶和去泛素化酶活性的方法,其步骤包括:1)收集来自实验验证数据库的真实相互作用集;将其与预测相互作用数据集合并,得到整合预测集;2)将用户提供的定量泛素化组学数据分别与真实相互作用集、整合预测集进行匹配,从匹配条...
  • 本发明涉及细胞游离DNA数据检测技术领域,具体涉及一种基于细胞游离DNA片段化特征的检测系统及方法,系统包括:cfDNA数据收集模块从临床数据集与公共数据集构建的合成数据集中采集样本;预处理模块对样本进行全基因组测序并筛选合格数据;特征提取...
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