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一种lincRNA小肽编码潜能鉴定方法及系统
本发明公开一种lincRNA小肽编码潜能鉴定方法及系统,属于计算机技术与生物信息学技术领域。该方法先将lincRNA序列处理为标准化序列集;再识别并整合去重潜在编码片段得到候选编码区域集合;提取各区域多维度特征编码后,经Mamba模型和机器...
高产单细胞筛选方法、系统、终端及介质
本发明提供一种高产单细胞筛选方法、系统、终端及介质,通过基于施加细胞溶液后打印芯片的各喷嘴内的细胞图像筛选单细胞,并由筛选的单细胞经过培养后检测的蛋白产量检测结果确定目标细胞样本,构建单细胞识别模型;基于所述单细胞识别模型,根据输入的施加细...
基于多视图信息重平衡学习的空间转录组学数据聚类方法
本申请提供了一种基于多视图信息重平衡学习的空间转录组学数据聚类方法,涉及生物信息技术领域,方法包括:对空间转录组数据进行预处理并构建空间邻接矩阵;构建模态特异性超图,得到超图特征,将超图特征与图卷积网络提取的空间邻域特征进行自适应融合,得到...
一种基于扩散模型的基因调控网络优化方法
本发明属于生物医学工程技术领域,公开了一种基于扩散模型的基因调控网络优化方法,包括:获取稳态条件下细胞的基因数据,并根据所述基因数据构建基因表达矩阵;基于扩散模型方法向所述基因表达矩阵中注入高斯噪声,生成一系列带噪数据序列;基于基因调控网络...
一种针对肠道菌群丰度的时间序列分析方法及装置
本发明提出一种针对肠道菌群丰度的时间序列分析方法及装置,属于肠道微生物学数据分析技术领域,解决了现有技术难以有效提取有限样本、非正态分布的肠道菌群丰度时间序列中的趋势与波动、时序关联、时序交互等特征的问题,本发明提出了一种针对肠道菌群丰度的...
一种面向稀疏网络的miRNA-mRNA相互作用预测方法
本发明公开了一种面向稀疏网络的miRNA‑mRNA相互作用预测方法,包括1)基于多方法交叉验证的高置信度基因筛选,获取包含肿瘤样本和正常样本的miRNA和mRNA表达谱数据;2)构建背景调控网络与图数据;3)引入虚拟节点以增强图连通性;4)...
基于基序搜索的酶元件深度学习挖掘方法、系统及其应用
本发明涉及一种基于基序搜索的酶元件深度学习挖掘方法、系统及其应用,所述方法包括以下步骤:根据目标酶的结构定位要求,确定至少一个保守基序;在预先构建的大规模蛋白氨基酸序列本地数据库中进行扫描,通过基序搜索获得所述保守基序对应的氨基酸序列集合,...
一种用于蛋白质抗原表位预测的深度学习方法及系统
本发明涉及蛋白质抗原表位预测技术领域,尤其涉及一种用于蛋白质抗原表位预测的深度学习方法及系统,方法包括:从SabDab数据库中采集带有表位注释的蛋白质链,构建用于学习训练的数据集;将蛋白质的三维结构表示为图结构,图结构的节点为氨基酸残基,边...
一种用于蛋白质交联质谱肽段对识别方法
本发明公开了一种用于蛋白质交联质谱肽段对识别方法。包括先构建肽段向量数据库,然后获取并预处理谱图数据,接着生成谱图表征序列,然后生成谱图嵌入向量,再在向量数据库中检索候选肽段,根据检索结果最终确定目标交联肽段及交联位点。本发明方法实现了显著...
用于恶性肿瘤淋巴侵袭判断的逆转录酶多聚酶链反应组合优化系统
本申请涉及估技术领域,公开一种用于恶性肿瘤淋巴侵袭判断的逆转录酶多聚酶链反应组合优化系统。包括:数据获取模块,用于获取肿瘤基因文库中的不同基因数据,对所述基因数据中的组学统计量指标进行系统聚类分析,通过系统聚类的方法组合出具有统计可能性的基...
一种基于中心对数比变换的微生物群落丰度预测方法
本发明公开了一种基于中心对数比变换的微生物群落丰度预测方法,属于微生物预测技术领域。通过中心对数比变换处理微生物丰度数据的成分特性,并结合独特的季节性周期编码对输入特征进行系统化预处理。通过构建一个专为表格数据设计的增强型Transform...
一种预测人和大鼠的药物肝脏清除率与分布容积的方法及模型
本发明涉及一种预测人和大鼠的药物肝脏清除率与分布容积的方法及模型。本发明利用图神经网络和注意力机制,对小分子化合物的人体和大鼠的生理药代动力学参数进行建模,设计全新的三阶段图神经网络架构,在化学上更具意义的“官能团”尺度上进行特征学习和交互...
基于强化学习的蛋白质层析过程优化方法及系统
本发明提供基于强化学习的蛋白质层析过程优化方法及系统,涉及强化学习技术领域,包括通过获取多源异构数据,进行多尺度分解建立分层机理知识库,结合实时运行数据分析构建混合驱动预测模型,实现对层析过程的状态预测,并利用分层反馈信息动态调节模型参数。...
基于时序神经网络的蛋白质层析纯化异常检测与控制方法
本发明提供基于时序神经网络的蛋白质层析纯化异常检测与控制方法,涉及时序神经网络技术领域,包括通过构建分离知识图谱并映射层析过程数据生成特征向量,利用双向递归结构的时序神经网络模型预测分离行为,进而建立优化目标函数生成最优工艺参数组合,最后将...
基于人工智能的生物信息学数据处理与分析集成系统
本发明提供基于人工智能的生物信息学数据处理与分析集成系统,涉及生物信息学与人工智能交叉技术领域,包括,数据采集模块:用于从生物信息学数据源获取原始数据。该人工智能的生物信息学数据处理与分析集成系统,通过在生物信息学数据处理流程中引入基于人工...
一种基于图神经网络的离体组织空间转录组数据分析方法
本发明公开了一种基于图神经网络的离体组织空间转录组数据分析方法,包括:从生物组织样本中获取包括空间位置信息和基因表达信息的数据,进行基因筛选预处理,获得空间变异基因集合;构建基因共表达图,同时构建点位空间图;基于编码器在基因共表达图和点位空...
基于多组学数据的阴道微生态失衡干预策略生成方法和系统
本申请提供基于多组学数据的阴道微生态失衡干预策略生成方法和系统,涉及数据分析技术领域,通过获取阴道微生态的多组学数据,多组学数据包括蛋白组数据、菌群组数据、代谢组数据以及转录组数据;对多组学数据进行降维和数据清洗处理,生成标准化数据集;对标...
基于表型指纹的致病基因预测方法、装置、设备及介质
本申请公开一种基于表型指纹的致病基因预测方法、装置、设备及介质。本方法由计算机执行,通过将基因与多种维度的表型之间的关联信息进行系统性整合和量化,在群体层面构建基因特异的表型指纹,能更全面地捕捉基因在不同表型维度上的复杂效应;还通过基因表型...
一种基于图神经网络的抗性基因发现方法及系统
本申请公开了一种基于图神经网络的抗性基因发现方法,涉及生物信息学与人工智能交叉技术领域,方法包括:获取宏基因组测序数据,与抗性基因数据库宽松比对得到候选序列;构建无向图;利用DNA语言模型提取候选序列的初始向量特征,将无向图以及初始向量特征...
UGT酶亚型的底物特异性预测方法及模型
本发明涉及UGT酶亚型的底物特异性预测方法及模型。基于定向消息传递神经网络,将小分子化合物的图结构表征与UGT酶特定蛋白质结合位点的特征进行深度融合,设计"分子+蛋白质结合位点"的双模态预测范式,构建深度学习模型,实现了从化合物中心预测向分...
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