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一种lincRNA小肽编码潜能鉴定方法及系统
本发明公开一种lincRNA小肽编码潜能鉴定方法及系统,属于计算机技术与生物信息学技术领域。该方法先将lincRNA序列处理为标准化序列集;再识别并整合去重潜在编码片段得到候选编码区域集合;提取各区域多维度特征编码后,经Mamba模型和机器...
基于全基因组测序的牛胚胎植前遗传评估方法及系统
本发明涉及生物信息处理技术领域,尤其涉及基于全基因组测序的牛胚胎植前遗传评估方法及系统,其方法包括:获取父本与母本全基因组测序数据、胚胎滋养层活检测序数据以及培养液游离脱氧核糖核酸测序数据;由父母本数据进行变异检测与单倍型定相形成单倍型数据...
基于量子计算的RNA序列预测蛋白质结构系统和方法
本发明公开了一种基于量子计算的RNA 序列预测蛋白质结构系统、方法和电子设备,基于量子计算的RNA 序列预测蛋白质结构系统包括:用户交互终端层,用于获取用户输入的目标RNA序列;经典计算层,与用户交互终端层和量子计算云平台层连接,用于对目标...
一种适配多种文库结构的单细胞测序数据特征序列检测方法
本发明提供了一种适配多种文库结构的单细胞测序数据特征序列检测方法。该方法通过自定义文库结构以及输出结构以适配多种不同的需求,并使用基于前缀树的模糊匹配以提高处理速度。
一种基于德布鲁因图的宏基因组物种水平分类方法
本发明公开了一种基于德布鲁因图的宏基因组物种水平分类方法,其将线性基因组与泛基因组作为互补的参考框架,并采用两阶段流程:首先,利用HIBF执行近似成员查询,以高召回、低开销地从数据库中筛出候选物种以及菌株;随后围绕这些候选构建ccDBG,在...
集成多变异注释与智能评分的遗传解读系统
本发明属于人工智能技术领域,具体涉及集成多变异注释与智能评分的遗传解读系统装置,包括:变异信息获取模块,用于收集待分析家系中各成员的患病情况、各成员的外显子变异位点信息,并根据收集的信息与预设的数据库中的数据进行比对分析确定变异类型,生成遗...
基于SNP突变频率相似度判断样本错配与污染的方法、装置、计算机设备
本申请属于基因检测技术领域,具体涉及基于SNP突变频率相似度判断样本错配与污染的方法、装置、计算机设备。本申请提供基于SNP突变频率相似度判断样本错配与污染的方法,通过利用同一患者SNP位点突变频率的线性相关性特征,能够准确识别样本间的匹配...
用于基因测序的维特比解码方法、介质和计算机程序产品
本申请提供了用于基因测序的维特比解码方法、介质和计算机程序产品。该方法包括:获取由循环神经网络生成的发射分数矩阵;执行后向遍历计算,从碱基序列的末端向起始端迭代计算针对每个时间步、批次和状态的后向概率,后向概率表征了对于相应的时间步和批次,...
一种融合多组学数据的克罗恩病早期诊断标志物筛选方法
本发明公开了一种融合多组学数据的克罗恩病早期诊断标志物筛选方法。该方法包括:构建克罗恩病演进时序特异性多组学样本集,通过纵向采样同步获取基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据;构建并应用深度多组学时序融合网络模型筛选候选标志物集合,该网络通过...
一种基于蛋白语言模型与等变图神经网络的多配体残基结合位点预测方法
本发明涉及一种基于蛋白语言模型与等变图神经网络的多配体残基结合位点预测方法。它解决了现有技术中蛋白质结合点位预测方法难以捕获残基间的空间依赖关系且对结构置信度较低的蛋白预测不稳定的问题。它包括S1、数据集构建;S2、序列与结构特征提取;S3...
一种基于纳米孔测序的实时药敏分析系统及方法
本申请提供了一种基于纳米孔测序的实时药敏分析系统及方法,对采集的临床样本进行病原体富集处理,进而进行纳米孔测序,以识别出目标病原体及目标病原体的多个耐药基因位点,依据每个耐药基因位点的测序覆盖深度、碱基平均质量值、以及独立读长支持数目确定所...
一种阿尔兹海默症生物标志物及其筛选方法
本发明提供了一种阿尔兹海默症生物标志物及其筛选方法,所述阿尔兹海默症生物标志物为CD44基因或其编码的蛋白。阿尔兹海默症生物标志物的筛选方法包括:首先通过GEO数据库筛选AD患者差异表达基因,并获取差异表达的铁死亡相关基因,对铁死亡相关的A...
基因组变异冷热点区域预测方法及装置
本发明公开了一种基因组变异冷热点区域预测方法及装置,包括步骤:S1,按照预设的滑动窗口长度对目标基因组区域进行切片处理,构建得到该窗口对应的多模态输入张量;S2,将所述多模态输入张量输入至预先训练好的深度学习预测模型中,通过全连接层输出所述...
一种基于液相杂交捕获技术的三七基因组育种芯片及其开发方法
本发明公开了一种基于液相杂交捕获技术的三七基因组育种芯片及其开发方法,包括以下步骤:S1、目标区域确认和位点筛选;S2、智能探针设计;S3、高效捕获检测和验证;S4、应用服务。本发明提供一种低成本、高灵活性、高精准度、高使用度、功能集中的液...
一种基于LAMA5表达的泛癌预后评估系统
本申请提供的一种基于LAMA5表达的泛癌预后评估系统,涉及泛癌预后评估技术领域,包括:获取多来源分子数据,并建立标准化数据输入通路,得到LAMA5基因分子信息,通过计算LAMA5基因分子信息的突变频率与基因拷贝数变异,完成样本标识与字段标准...
一种基于蛋白语言模型的不平衡肽激素预测方法
本发明涉及一种基于蛋白语言模型的不平衡肽激素预测方法。它解决了现有技术中肽激素预测方法在类别不平衡条件下识别性能下降的问题。它包括S1、数据集的收集与预处理;S2、序列特征嵌入与编码;S3、模型构建;S4、模型性能优化;S5、模型性能评估;...
基于结构预测的病毒载体靶向性优化方法及系统
本发明属于病毒载体设计技术领域,公开了一种基于结构预测的病毒载体靶向性优化方法及系统,该方法包括,先获取目标受体与候选病毒包膜蛋白的结构信息;再将目标受体结构信息输入经训练的深度学习结构预测模型,输出关联三维空间坐标的糖基化屏蔽场,其数值量...
基于多维拓扑分析与动态能学耦合的EDCs诱发HDP共同枢纽靶点的筛选方法
本发明公开了一种基于多维拓扑分析与动态能学耦合的EDCs诱发HDP共同枢纽靶点的筛选方法,该方法包括:构建环境内分泌干扰物(EDCs)与妊娠期高血压疾病不同亚型(CH、GH、PE/EC)的共同作用靶点;构建PPI网络,创新性地采用最大团中心...
基于深度学习与3D特征的蛋白质序列设计方法及系统
本发明提供一种基于深度学习与3D特征的蛋白质序列设计方法及系统,该方法包括获取目标蛋白质的3D结构数据;基于理化环境编码框架,提取3D空间结构特征;获取目标蛋白质的伪多序列比对信息,并从中提取多序列上下文特征;构建具有双向门控机制的记忆调优...
RNA的二级结构预测方法及装置、设备、存储介质
本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种RNA的二级结构预测方法及装置、设备、存储介质,通过将待测RNA序列分别输入多个不同的模型预测输出多个碱基配对,根据所有碱基配对识别出多个茎,茎包括至少指定数量个连续的碱基配对,且茎内任意两个碱基配对...
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