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  • 本发明属于生物信息学领域,涉及一种改进集成深度学习的细胞通讯配体受体互作预测方法。首先,对配体和受体的生物学序列特征进行提取与降维,构建多模态特征输入;其次,构建改进深度神经网络分支,引入批归一化层与LeakyReLU激活函数,解决梯度消失...
  • 本发明公开了一种基于肉牛肠型‑宿主基因互作的靶向营养源挖掘方法,具体涉及生物信息数据处理领域,用于解决现有营养源开发缺乏分子机制验证及靶向性差的问题。首先,基于微生物组与转录组数据划分营养关联肠型,构建共表达网络筛选受特定肠型驱动的宿主共表...
  • 本发明公开了一种基于人工智能的疾病药物基因三元组预测方法及系统,属于生物医学知识图谱领域,先对生物医学知识图谱数据集预处理,构建并对齐疾病药物基因实体初始特征矩阵;再通过位置感知图编码模块输出融合全局拓扑与节点位置的增强节点表示,经多分支特...
  • 本发明提供一种基于自监督对比学习与邻域注意力融合的scRNA‑seq数据插补方法,针对高稀疏性及批次效应导致的表示偏移与结构保持困难,采用两阶段无监督框架:第一阶段在非零位置施加随机置零扰动构造增强视图,基于对比学习训练编码器获得对drop...
  • 本发明涉及细胞亚群识别技术领域,具体为一种基于特征阈值的细胞亚群识别方法及系统,本发明中,单细胞取值按固定顺序逐项比对阈值区间边界,命中区间编号按位写入,区间编号序列经哈希算法按顺序拼接生成唯一阈值组合标识,哈希压缩把高维阈值命中向量转为短...
  • 本公开的实施方案包括实现支持ML的细胞疾病模型,以用于验证干预、鉴定为干预的可能响应者的患者群体,以及开发治疗性的构效关系筛。为了生成细胞疾病模型,将来自人类遗传队列、文献以及通用细胞或组织水平基因组数据的数据组合,以揭示引起特定疾病的因素...
  • 本发明涉及生物识别模型技术领域,公开了一种基于内含子保留水平的阿尔茨海默病相关生物通路的识别方法、识别模型及其构建方法。首先收集多个包含人类大脑和血液的RNA‑seq样本的数据集;第二,计算样本的基因表达量与内含子保留表达量;第三,构建标准...
  • 一种面向单细胞多模态数据中的自监督跨模态对齐与联合表征学习方法,它涉及一种自监督跨模态对齐与联合表征学习方法。本发明为了解决现有技术中单一模态分析无法关联T细胞抗原特异性与功能表型、多模态工具表征颗粒度不足及泛化能力弱的问题。本发明的步骤包...
  • 本申请实施例提供的用于准确计算细胞产品中单细胞分子含量的方法和装置,涉及细胞检测技术领域。该方法包括:在确定细胞产品中单细胞分子的表达量和/或含量时,可以先将单细胞组学数据输入至神经网络模型中,得到代表单细胞组学数据的多维非线性核心特征;再...
  • 本发明公开了一种hPirin蛋白酶抑制剂的高通量筛选系统与应用,涉及生物医学工程技术领域,包括,靶点结构建模与筛选体系构建模块;高通量虚拟筛选模块;体外酶活性验证模块;酶动力学表征模块;细胞生物学活性验证模块;本发明突破传统转录抑制剂的非特...
  • 本发明公开了一种基于共价键对接的酯化反应脂肪酶筛选方法,属于蛋白对接模拟技术领域。本发明通过构建“酰基化酶中间体”参数,再对其执行共价对接与能量筛选,实现对脂肪酶反应活性与底物选择性的预测,克服传统对接无法自动识别羰基碳、无法建立Ser–C...
  • 本发明提供了一种纳米孔测序方法、终端设备及存储介质,利用固态亚纳米孔优异的机械与化学稳定性,采用阴离子表面活性剂SDS对蛋白质进行变性处理。SDS在破坏蛋白质高级结构的同时,为其表面包裹均匀负电荷,实现电场驱动下的全长蛋白线性化易位。采用自...
  • 本发明公开一种基于微生物指纹的粮食产地溯源方法及系统。方法包括:采集粮食样本并获取粮食样本的微生物指纹信息;基于微生物指纹信息构建训练集和测试集;将训练集输入随机森林学习框架中,以粮食产地为预测目标,以微生物指纹数据为输入变量进行训练,生成...
  • 本发明公开一种基于微生物指纹的粮食新陈度的鉴定方法及系统。方法包括:采集粮食样本并获取微生物指纹信息;基于微生物指纹信息,构建训练集和测试集;将训练集输入随机森林学习框架中,以粮食新陈度为预测目标,以微生物指纹数据为输入变量进行训练,生成随...
  • 本发明公开一种基于微生物指纹的玉米真菌毒素污染预测方法及系统。方法包括:采集玉米样本并获取微生物指纹信息及真菌毒素污染信息;基于微生物指纹信息与真菌毒素污染信息构建训练集和测试集;将训练集输入随机森林学习框架,以真菌毒素污染水平为预测目标,...
  • 本发明公开了一种基于图神经网络的视紫红质蛋白最大吸收光波长预测方法。包括:根据待预测的视紫红质蛋白的氨基酸序列,生成三维结构模型;根据待预测的视紫红质蛋白的三维结构模型,生成配体口袋图;将配体口袋图输入预先训练好的最大吸收波长预测模型,得到...
  • 本发明涉及生物序列信息识别技术领域,具体为序列识别方法及其模型训练方法、系统、设备、存储介质。为解决现有技术在处理高通量测序数据时效率与精度难以兼顾的问题,本发明提出一种包括全局表征组件和局部表征组件的模型。训练时,对全局表征组件采用基于动...
  • 本发明公开了一种基于泛基因组图谱的结构变异识别方法及系统,利用三代测序数据对泛基因组图谱进行扩展/增强;接收输入的测序数据,将所述测序数据与扩展/增强后的泛基因组图谱进行比对,获得图参考比对结果,基于所述图参考比对结果,识别测序数据中的结构...
  • 本申请属于生物医药技术领域,具体涉及蛋白表达系统的CDS优化方法,及基于该系统的外源蛋白生产方法。本申请通过计算编码外源蛋白的CDS同义密码子对应的tRNA需求与供给的欧氏距离,通过实验得到每个分组中单个D值对应的单条CDS的表达量,获得表...
  • 本发明提供了一种基于甲基化修饰的基因调控网络通路效能表征方法及系统,该方法首先对原始多组学数据,包括基因表达矩阵与DNA甲基化矩阵进行结构化预处理,通过特征筛选、电路式拓扑重构及信号流映射,生成与样本一一对应的有向基因调控网络;在此基础上,...
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