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干细胞培养基成分自适应优化系统及方法
本发明公开了干细胞培养基成分自适应优化系统及方法, 涉及生物工程技术领域, 用于精准调节培养基成分并维持多能性。系统包括代谢失衡诊断模块, 通过非侵入式光谱与分泌组分析捕获代谢物失衡信号并识别毒性物质, 输出代谢冲突的特征向量;通路重构模块...
一种基于曼巴模型与半监督学习的RNA序列分类方法
本发明提出一种基于曼巴模型与半监督学习的RNA序列分类方法, 属于生物信息学领域。首先, 对RNA序列提取多尺度稀疏特征, 并通过编码器网络将高维特征压缩至低维潜在空间向量, 同时进行L2归一化以增强特征可分性。其次, 在残差结构中引入基于...
一种构建功能基因蛋白识别模型的方法及装置
本发明提供了一种构建功能基因蛋白识别模型的方法及装置, 该方法包括:获取功能基因蛋白参考序列;根据获取的功能基因蛋白参考序列, 筛选与参考序列同源的序列, 生成用于构建模型的序列集;将生成的所述序列集随机划分为训练集和测试集, 根据所述训练...
一种基于GPT大语言模型的酶功能预测算法
本发明基于深度学习技术在生物酶中的应用, 结合GPT模型, 提出了一种预测酶的功能的算法。包括:序列嵌入、掩码多头自注意力机制提取序列特征。首先从公共数据库获取酶序列数据, 划分预训练与微调数据集;使用酶序列自监督预训练GPT模型, 学习序...
一种融合多组学数据的生物标志物识别方法
本发明提出了一种融合多组学数据的生物标志物识别方法, 包括数据清洗、归一化、整合、特征提取与选择等步骤。数据清洗去除噪声和校正偏差, 归一化缩放和标准化数据分布, 整合关联不同组学数据并进行对齐处理;特征提取基于统计、频域和图像分析, 特征...
一种基于背景噪音模型的ctDNA去噪背景参考系统
本发明公开了一种基于背景噪音模型的ctDNA去噪背景参考系统, 涉及分子诊断与生物信息学技术领域, 包括数据预处理模块、背景噪音模型构建模块、集成线性学习模型模块、去噪与变异识别模块、结果验证与输出模块。本发明通过提供完整系统架构, 覆盖从...
蛋白质DDG预测模型优化方法、蛋白质DDG预测方法及相关装置
本发明的实施例提供了一种蛋白质DDG预测模型优化方法、蛋白质DDG预测方法及相关装置, 涉及生物信息数据处理技术领域。该方法包括:获取野生型蛋白质三维结构数据、突变体蛋白质三维结构数据以及第一DDG值。分别将野生型蛋白质三维结构数据与突变体...
一种基于全基因组选择的青鱼生长性状最佳预测体系及其构建方法和应用
本发明公开了一种基于全基因组选择青鱼生长性状最佳预测体系及其构建方法和应用, 由最佳GS统计模型GBLUP模型和数量为12000的最佳SNP基因型位点集组成, 构建方法包括:对499尾青鱼进行基因组重测序和基因分型, 获得237730个高质...
生存期预测模型的训练方法、生存期预测方法及装置
本公开提供一种生存期预测模型的训练方法、生存期预测方法及装置, 所述生存期预测模型的训练方法包括:获取群体训练数据和空间训练数据。分别根据群体训练数据和空间训练数据对待训练的生存期预测模型进行训练, 得到训练完成的生存期预测模型。通过联合利...
基于数据插值和细胞类型反卷积进行空间域识别的方法
本发明提出基于数据插值和细胞类型反卷积进行空间域识别的方法, 属于生物信息学技术领域, 本发明为解决传统方法在低分辨率空间转录组数据中无法利用相邻点间空隙信息和未能充分整合细胞类型在组织空间结构层面的先验信息的问题, 包括:获取空间转录组数...
一种基于微生物群落的排水系统外水来源预测方法、存储介质及设备
本发明公开了一种基于微生物群落的排水系统外水来源预测方法、存储介质及设备, 包括:收集排水系统进水、河水、地下水以及排水系统周边居民小区生活污水的水质参数、环境因子、微生物类型和代谢物浓度;将收集的微生物类型和代谢物浓度进行微生物群落时空解...
一种高分泌水平信号肽的设计方法
本发明公开了一种高分泌水平信号肽的设计方法, 主要包括以下步骤:构建信号肽分泌目标领域数据集和源领域数据集;实施迁移学习, 训练出预测信号肽分泌水平的分类和回归模型;基于目标领域数据集信号肽序列的氨基酸种类‑位置概率分布, 建立信号肽生成器...
基于改进自注意力与Mamba双模块的不同长度基因组序列编码方法
基于改进自注意力与Mamba双模块的不同长度基因组序列编码方法, 它涉及一种不同长度基因组序列编码方法。本发明为了解决现有技术中基因组序列无法合理输入至神经网络模型的问题。本发明在数据处理序列特征提取过程, 提取不同长度基因组序列的kmer...
微生物组数据驱动的土壤肥力预测方法及系统
本发明提供了微生物组数据驱动的土壤肥力预测方法及系统, 涉及数据预测技术领域, 包括:配置土壤采样矩阵;执行H频次的间歇性分层采样, 并执行微生物组数据测定, 得到微生物群落时序矩阵;进行肥力养分转换处理后, 执行动态演变规律捕捉, 预测输...
一种玉米-固氮菌互作的智能识别方法及系统
本发明涉及生物信息分析技术领域, 具体为一种玉米‑固氮菌互作的智能识别方法及系统, 包括以下步骤, 利用玉米根际样本获取编码信息及分泌物浓度, 归类分泌趋势生成根行为响应数据, 筛选行为一致菌种构建菌群结构序列, 识别组合趋同性输出互作模式...
一种融合基因动态监测的甲状腺癌NGS联合分析方法
本发明涉及核酸分子检测技术领域, 公开了一种融合基因动态监测的甲状腺癌NGS联合分析方法。本发明方法通过将高通量测序与DNABERT深度学习算法相结合, 使得能够从海量测序数据中识别出高度特异的单核苷酸变异(SNV)和融合基因标志物, 用于...
一种深度强化学习驱动的多肽药物分子生成方法
本发明公开了一种深度强化学习驱动的多肽药物分子生成方法, 属于生物信息学技术领域, 包括如下步骤:S1:基于图预训练的多肽的氨基酸序列表征、S2:融合活性与ADMET属性的多成药目标优化、S3:基于Actor‑critic强化学习的分子生成...
一种酶的定向进化方法及相关装置
本申请提供一种酶的定向进化方法及相关装置, 涉及酶的定向进化领域。根据候选氨基酸序列数据的蛋白特征编码数据, 通过预测模型对突变的候选氨基酸序列数据进行活性预测, 筛选出较优的目标氨基酸序列数据, 然后通过自动化实验操作构建目标氨基酸序列实...
一种蛋白质序列生成方法、装置、系统及存储介质
本发明提供一种蛋白质序列生成方法、装置、系统及存储介质, 涉及生物信息技术领域。所述生成方法包括:获取待分析蛋白质序列并构建序列数据集;构建不同功能属性的多属性条件向量;构建蛋白质序列生成模型;将序列数据集中的待分析蛋白质序列编码为离散表示...
一种基于加权图网络与标签传播的宏基因组病毒分类方法
一种基于加权图网络与标签传播的宏基因组病毒分类方法, 它涉及一种宏基因组病毒分类方法。本发明为了解决现有技术中ICTV分类标准的动态适应性不足、数据类别不平衡, 且“暗物质”分类难的问题。本发明在数据库更新与构建过程, 获取最新的病毒分类样...
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