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  • 本发明提供了一种基于三维基因组互作和共表达特征的肿瘤驱动IncRNA筛选方法,该方法包括:获取包含肿瘤TAD、表达量数据、肿瘤驱动PCG和lncRNA基因信息的肿瘤信息;根据肿瘤信息计算CDT、RNA‑DNA互作特征和共表达特征;根据CDT...
  • 本公开提供了一种探针集合的设计方法及其应用。使用本公开所提供设计方法设计探针集合既满足用药靶点检测需要,又提升了检测性能,在MRD监测方面具有更长的提前时间,具有广泛的临床应用前景。
  • 本发明涉及数据处理技术领域,尤其涉及一种基于二代测序技术的基因组测序数据分析方法,该方法获取待压缩的碱基序列;设定k‑mer的k取值范围,针对k取值范围内任一k取值,在碱基序列中获取任一k取值的k‑mer子串,组成目标集合,构建目标集合的频...
  • 本发明提供一种化合物致突变性评估方法及系统,属于分子生物学和化工技术领域,包括:培养符合要求的人源细胞,随后采用不同浓度的所述化合物对所述人源细胞进行处理;从所述人源细胞中提取基因组DNA并进行测序;基于测序数据获取总碱基数据及突变碱基数据...
  • 本发明为基于异构图网络的宏基因组功能注释方法及系统,获取人类宏基因组测序信息并过滤;根据宏基因内部信息构成宏基因组异构图:分别建模contig结点和基因结点,contig结点与基因结点之间通过所属关系来连接;基因结点之间通过序列相似性来决定...
  • 本发明公开了一种用于急性上呼吸道感染易感性的预测标志物及预测方法,用于解决当前急性上呼吸道感染易感风险预测准确性较低的问题。首先提供一种用于急性上呼吸道感染易感性的预测标志物,所述预测标志物为综合考虑人体健康状态血常规数据与基线血液转录组数...
  • 本说明书实施例提供了一种TPD52免疫调节作用的研究方法及系统,其中,方法包括:获取乳腺癌肿瘤微环境的单细胞转录组数据;基于所述数据,利用机器学习算法鉴定TPD52为免疫调节关键危险基因;在多中心队列中验证TPD52表达与患者预后的关联;基...
  • 本发明公开了一种CRPC患者奥拉帕尼耐药风险预测模型构建方法、装置及介质,属于肿瘤精准医疗、生物信息学与分子靶向治疗领域,所述方法为:获取肿瘤细胞系的bulk RNA表达数据和CRPC患者肿瘤样本的单细胞RNA测序表达矩阵;采用Scisso...
  • 本发明用于花朵选种育种技术领域,公开了一种基于融合分子标记的花朵智能选种育种系统,包括样本采集模块、分子标记检测模块、数据融合模块、智能分析模块和选种育种模块。该基于融合分子标记的花朵智能选种育种系统,通过样本采集模块获取花朵样本,分子标记...
  • 本发明公开了一种B族链球菌选择性培养基的优化方法,包括获取不同配方的培养基数据进行进行生长曲线分析,获得生长动力特征和第一数据集,根据第一数据集对菌落数据进行时序预测,使用预测结果和生长动力特征进行线性拟合,对菌落数据进行变点分析,根据优化...
  • 本发明公开了基于多源知识库与AI的植物组织培养方案生成系统及方法。该系统包括:①数据采集单元,用于汇聚相关数据;②知识库构建单元,对多源异构数据进行清洗融合与本体建模;③AI模型训练单元,通过深度学习构建多维参数预测函数组;④方案生成与评估...
  • 本发明公开的属于生物医学工程技术领域,具体为一种基于多层次感知聚合和深度分层图混合学习器的微生物‑疾病关联预测方法及装置,包括具体步骤如下:S1:获取已知的微生物‑疾病关联信息,构建微生物‑疾病关联矩阵A1;同时构建微生物综合相似性矩阵CM...
  • 本申请涉及肿瘤预后预测技术领域,公开了一种MGMT阴性胶质母细胞瘤患者替莫唑胺耐药的预测模型,该方法包括获取胶质母细胞瘤细胞系替莫唑胺敏感株与抵抗株的基因表达谱数据,通过差异分析筛选差异基因;将差异基因在TCGA数据库的MGMT阴性患者队列...
  • 本申请提供了一种基于深度学习的多切片空间组数据对齐及数据增强方法,包括:收集多个发育阶段不同组织的切片,并利用空间转录组学技术获得每个切片单细胞水平的基因表达数据和各细胞在组织中的空间位置信息;基于每个切片的基因表达数据和空间位置信息,结合...
  • 本发明公开简化输入策略预测miRNA‑LncRNA‑疾病网络中的多类型关联方法,涉及生物分子关联预测技术领域,包括以下步骤:数据获取与预处理、异质网络构建、深度特征提取、特征融合、多任务联合预测以及结果输出;本发明通过简化输入策略与深度特征...
  • 本发明涉及生物医学技术领域,具体公开了一种基于系统生物学分析的中枢神经系统药物治疗机制的分析方法。本发明采用包括转录组学、蛋白组学和受体动力学在内的系统生物学分析,对中枢神经系统药物的治疗机制进行研究。三者结合可通过“基因转录→蛋白功能→受...
  • 本发明涉及一种细胞分类技术领域,是一种融合多尺度注意力机制和掩码自编码的scRNA‑seq数据聚类分析模型构建方法、聚类分析方法及相关装置,包括获取若干scRNA‑seq数据集;利用数据集对初始网络模型进行训练,基于损失函数,得到scRNA...
  • 本发明涉及医学辅助检测技术领域,具体地说,涉及基于血浆游离DNA甲基化图谱的卵巢癌辅助检测系统。其数据计算单元、图谱区域单元和计算检测单元。本发明的差异区域模块将历史数据中的卵巢癌患者与受试者cfDNA甲基化图谱进行匹配,匹配出相同基因组位...
  • 本发明公开了一种蛋白质相互作用预测方法、装置及储存介质,涉及生物医学技术领域,方法包括:S1、识别二维蛋白质结构图的官能团,S2、捕捉蛋白质的几何结构信息,获取两个蛋白质的原子特征,S3、定义两个蛋白质的一维序列分别表示为U和V,S4、更新...
  • 本发明公开一种基于遗传算法的鼻咽癌差异表达基因自动检测系统,涉及鼻咽癌早期诊断技术领域。本发明在遗传算法框架下通过集成多种机器学习算法,综合评估各算法表现作为适应度函数,显著增强了基因检测方法的稳定性和泛化能力。同时,创新性地引入SHAP值...
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