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一种基于宏基因组测序的病媒生物携带病原体分析方法
本发明公开了一种基于宏基因组测序的病媒生物携带病原体分析方法, 属于病媒生物分析技术领域,通过构建多维度数据融合框架,实现了病原体识别从单一序列比对到系统生物学解析的跨越。其核心优势在于将样本采集阶段的生态背景数据与测序数据深度耦合,通过动...
大豆蛋白酶解后氨基酸与肽的比例调控方法及系统
本发明涉及生物技术领域,公开了大豆蛋白酶解后氨基酸与肽的比例调控方法及系统,该方法包括采集整个酶解过程中的酶解耦联参数生成时间序列数据,基于此数据得到多维动态协方差矩阵,通过该矩阵识别显著性酶交互并生成列表;依据列表构建多层次酶交互网络模型...
6-HB靶向膜融合抑制肽预测方法、装置、设备及介质
本发明涉及深度学习技术领域,公开了一种6‑HB靶向膜融合抑制肽预测方法、装置、设备及介质,方法包括:生成靶向6‑HB的膜融合抑制候选肽;将膜融合抑制候选肽输入预先构建的6‑HB靶向膜融合抑制肽预测模型进行分类预测,获得膜融合抑制候选肽的分类...
基于势能差最大化的抗原抗体相互作用势能矩阵优化方法
本公开的实施例公开了基于势能差最大化的抗原抗体相互作用势能矩阵优化方法。该方法的一具体实施方式包括:基于初始化势能矩阵,确定训练样本集中各个训练样本的天然复合物平均能量值;对上述训练样本集中各个训练样本中的抗原抗体复合物晶体结构进行结构调整...
环境复杂样品中新污染物及其结构类似物的自动识别方法
本发明公开了一种环境复杂样品中新污染物及其结构类似物的自动识别方法,该方法首先利用皮尔逊相关系数分析样品间物质丰度的共现性,并引入程序空白扣除与IQR‑Fisher Z变换异常值处理以提升可靠性。随后,基于高相关性与谱图相似性构建分子网络,...
一种基于特征集合的空间转录组细胞类型鉴注释方法
本申请提供了一种基于特征集合的空间转录组细胞类型鉴注释方法,涉及生物信息分析技术领域。包括以下步骤:S101,提供空间转录组基因表达矩阵和注释有细胞类型的单细胞转录组基因表达矩阵;S102,计算单细胞转录组基因表达矩阵中每个细胞类型的标志基...
一种DNA甲基化预测方法和相关设备
本申请公开了一种DNA甲基化预测方法和相关设备,方法包括:获取多个物种的DNA甲基化数据,预处理得到数据样本集;利用数据样本集对预设的深度学习模型进行迭代优化,得到初始预测模型;利用目标物种的数据样本集对初始预测模型进行参数微调,得到目标预...
用于微卫星分析的方法和系统
本公开提供了用于微卫星分析的方法和系统,特别是用于对样本中的微卫星和次要等位基因进行分类的方法和系统。此外,本公开提供用于基于微卫星位点生成针对病症的分类器和用于执行泛癌症测定的方法和系统。所述方法和系统可以涉及来自受试者的核酸样本的下一代...
一种基于多特征融合的新抗原免疫原性预测方法及系统
本发明提供了一种基于多特征融合的新抗原免疫原性预测方法及系统,属于机器学习技术领域,该方法包括:将候选肽段序列输入到抗原胞内处理预测模型中得到表征胞内处理能力的得分;将候选肽段序列输入到预训练的Transformer模型中得到候选肽段的序列...
一种用于游离DNA的甲基化标记识别方法
本发明公开了一种用于游离DNA的甲基化标记识别方法,包括以下步骤:基于全基因组甲基化测序数据的片段甲基化水平,识别异常组织相对正常对照组织的三类差异甲基化区域;基于异常组织M‑DMR集合与正常对照组织特异性低甲基化区域集合,识别异常产生过程...
一种病原识别与患者基因型特征的联合分析方法
本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种病原识别与患者基因型特征的联合分析方法。本发明首先对阳性临床样本进行宏基因组测序,获取原始测序数据后,对其分别进行质控处理和数据分类,识别出致病病原体DNA序列和宿主DNA序列,之后对致病病原体DNA...
卵巢癌细胞生长、肿瘤形成与免疫逃逸相关基因的CRISPR文库筛选方法
本发明属于肿瘤治疗技术领域,具体涉及卵巢癌细胞生长、肿瘤形成与免疫逃逸相关基因的CRISPR文库筛选方法。所述sgRNA文库包含靶向选自MusCK文库中80个基因的sgRNA。本发明使用了靶向4, 922个与肿瘤的起始、进展和免疫调节有关基...
一种酶辅助的多肽片段无标记序列读出方法
本发明公开了一种酶辅助的多肽片段无标记序列读出方法,包括以下步骤:利用纳米孔道分别检测长度差异和氨基酸差异的多肽的阻断离子流信号构建长度差异、氨基酸差异的多肽数据库;基于多肽数据库构建并训练分类模型;利用纳米孔道检测目标多肽的酶切产物得到相...
基于低深度测序数据进行遗传图谱构建或基因定位的装置和方法及应用
本发明公开了基于低深度测序数据进行遗传图谱构建或基因定位的装置和方法及应用。本发明利用重测序技术对每一个作图群体品系进行约0.1×的超低深度测序,对亲本进行较高深度测序,然后基于测序数据检测追溯作图群体每个品系的全基因组窗口中双亲单倍型(包...
一种基于单拷贝基因序列的杨属杂交种亲本来源鉴定方法、系统、设备及介质
本发明属于基因测序技术领域,具体涉及一种基于单拷贝基因序列的杨属杂交种亲本来源鉴定方法、系统、设备及介质,该方法首先构建包含杨属五大派系参考物种的单拷贝基因序列参考库,每条序列包含基因编码区及其上下游延伸序列;然后获取待测样本的二代测序数据...
基于调控通路扰动分析的基因异常调控检测方法
本发明涉及生物信息领域,尤其涉及一种基于调控通路扰动分析的基因异常调控检测方法,该方法包括:采集生物样本与通路结构数据;通过基因动态行为与通路上下文信息获取加权优化的通路扰动评分;通过差异表达显著性与样本间一致性获取基因动态影响力因子;通过...
一种基于条件变分自编码器的空转基因表达填补方法
本发明公开了一种基于条件变分自编码器的空转基因表达填补方法,包括:设计用于单细胞转录组数据和空间转录组数据联合分析的统一框架,获取单细胞转录组测序表达谱数据、空间转录组表达数据以及用于编码组织内局部邻域协方差的COVET矩阵;通过注意力增强...
一种针对三代全长转录本测序数据寻找碱基突变的方法、系统、设备及介质
本发明涉及生物信息学技术领域,公开一种针对三代全长转录本测序数据寻找碱基突变的方法、系统、设备及介质,本发明通过直接处理三代全长转录本测序数据,将碱基突变精准定位至特定转录本,准确解析多个突变在同一转录本上的共现关系,有效克服二代短读长测序...
基于长链非编码RNA多组学整合分析的因子分析系统
本申请涉及生物信息学与分子生物学技术领域,公开了一种基于长链非编码RNA多组学整合分析的因子分析系统。系统包括:多组学数据获取模块,配置为获取包含长链非编码RNA相关的多模态组学数据;数据预处理模块,配置为对多模态组学数据进行预处理,生成统...
基于糖代谢和乳酸代谢相关基因的肝癌分子亚型分型和预后模型构建方法及其应用
本发明涉及生物医学技术领域,具体涉及一种基于糖代谢和乳酸代谢相关基因的肝癌分子亚型分型和预后模型构建方法及其应用。本发明首次基于糖代谢基因和乳酸代谢基因的协同调控网络构建了肝癌亚型的分型和预后模型,构建的肝癌分子亚型分型包括包括Cluste...
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