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一种基于InDel遗传距离预测品种间产量优势的模拟方法
本发明涉及分子标记辅助育种技术领域,公开了一种基于InDel遗传距离预测品种间产量优势的模拟方法,利用籼粳基因组特异位点的差异,开发出一套基于InDel分子标记鉴定籼粳属性的方法,运用19个InDel标记,建立籼粳分类的标准,可用于水稻籼粳...
一种基于血清学的青少年结核病快速诊断方法的实施与应用
本发明公开一种基于血清学的青少年结核病快速诊断方法。本发明为青少年结核病诊断提供了一种经济高效的方法。本发明基于临床活动性青少年结核病患者的血清蛋白组学,以寻找基于血清学的结核病快速诊断方法。我们通过多种多种机器学习算法发现,载脂蛋白A1(...
通过分子标志物表达量诊断白塞病的系统、试剂盒
本公开提供了通过分子标志物表达量诊断白塞病的系统、用于定量检测分子标志物表达量的试剂在制备用于诊断白塞病的试剂盒中的用途、用于诊断白塞病的试剂盒、分子标志物在制备用于诊断白塞病的试剂盒中的用途,所述分子标志物包括AMT自身抗体、PRSS8自...
一种基于多组学分析的林木杂交亲本精准选配方法
本发明涉及林木杂交技术领域,且公开了一种基于多组学分析的林木杂交亲本精准选配方法,包括以下步骤:S1:多组学数据获取:对林木种群个体进行基因组测序、转录组分析、蛋白质组学分析和代谢组学分析,获取遗传变异位点、基因表达量、蛋白质表达丰度和代谢...
一种单基因遗传病致病突变的打分排序方法及系统
本发明公开了一种单基因遗传病致病突变的打分排序方法及系统,涉及生物医疗技术领域,该方法包括:基于预先获取的表型数据和文献摘要,利用混合策略对预先获取的症状描述进行标准化表型术语提取,并通过相似度比较法对标准化表型术语与预先获取的基因突变数据...
基于多重约束的反平行DNA三链体设计方法及系统
本发明公开了基于多重约束的反平行DNA三链体设计方法及系统,涉及DNA三链体靶向基因技术领域,包括以下步骤:构建mCGR初始化模型,依据序列长度及基础约束调整矩阵迭代规则,生成满足约束的所有可能序列集合;将上述序列集合映射为流网络节点,通过...
一种基于Ricci曲率加权的蛋白质-配体对接方法
本申请涉及一种基于Ricci曲率加权的蛋白质‑配体对接方法。该方法包括以下步骤:获取训练数据集;选择训练数据集中的一组数据,作为第一数据;利用Ricci曲率、ESM‑2、TorchDrug方法,将所述第一数据编码转化,得到第一蛋白质配体图;...
变异检测方法、检测指标处理方法、装置、设备及介质
本公开提出一种变异检测方法、检测指标处理方法、装置、设备及介质,其中,变异检测方法包括:获取每个位点的变异信息,其中,变异信息用于描述相应位点的碱基和参考基因组的碱基的比对情况;根据变异信息,确定与位点对应的第一检测指标,其中,第一检测指标...
一种二代测序数据驱动的无表型遗传变异智能判读系统和方法
本发明涉及遗传变异判读系统的技术领域,提供了一种二代测序数据驱动的无表型遗传变异智能判读系统和方法,其系统包括测序数据导入终端、无表型变异注释终端、稀有变异结构建模终端、智能推断与分型终端和结果可视化终端;测序数据导入终端用于导入原始格式测...
基于胃泌素血浆蛋白质组学的多系统疾病分析方法
本发明提供了基于胃泌素血浆蛋白质组学的多系统疾病分析方法,其包括以下步骤:A、利用生物样本库的队列研究数据,分析大量经过基线评估的成年个体,并测定了若干血浆蛋白;B、采用多变量Cox比例风险模型分析胃泌素(GAST)的标准化蛋白表达(NPX...
脓毒症患者不同生命周期细胞死亡与免疫抑制生物标志物识别与应用
本发明的脓毒症患者不同生命周期细胞死亡与免疫抑制生物标志物识别与应用,通过收集不同年龄段脓毒血症患者与正常对照组的转录组数据,利用生物信息学进行差异表达基因分析,结合CIBERSORT算法估算免疫细胞浸润,并通过相关性分析探讨DEGs与特定...
一种基于分子间不同类型关联关系的具有生物学可解释性的决策规则算法
本发明涉及一种基于分子间不同类型关联关系的具有生物学可解释性的决策规则算法,包括输入乳腺癌的组学数据,充分利用分子间正线性关联关系、负线性关联关系和非线性关联关系对组学数据进行全面分析,利用联合概率密度函数Δij筛选具有强预测能力的分子特征...
使用光学断层扫描对细胞进行形态计量学基因分型以检测肿瘤突变负荷
本发明公开一种用于开发一种或多种形态计量学分类器以识别肿瘤突变负荷(TMB)的方法。该方法提供了表征TMB的非侵入性方法,TMB在肿瘤发展的早期阶段对肿瘤有反应并且与肿瘤的大小无关。该方法允许针对患者可能患有的癌症的特定表征的癌症治疗,从而...
一种基于图神经网络迁移学习的蛋白质-配体解离速率预测方法
本发明公开了一种基于图神经网络迁移学习的蛋白质‑配体解离速率预测方法。属于蛋白质‑配体解离速率预测领域。该方法首先整合公开数据库与文献动力学数据,构建包含蛋白质结构、配体结构及解离速率参数的数据集。利用pdbfixer修复蛋白结构,RDki...
基于基因药物互作的候选药筛选方法、系统、介质及设备
本发明公开了一种基于基因药物互作的候选药筛选方法、系统、介质及设备,属于生物医药技术领域,所述方法为:获取耳聋患者异常基因数据集,输入耳聋基因‑候选药关系数据库匹配,得到对应候选药;数据库构建过程为:获取耳聋风险基因数据集、药物‑靶基因网络...
数据依赖性采集(DDA)质谱法
一种数据依赖性采集(DDA)质谱方法包括:电离样品以产生样品离子;通过执行一个或多个MS1质量分析扫描来分析该样品离子以便获得MS1数据;从该MS1数据中标识一个或多个前体离子;以及然后通过执行一个或多个MS2质量分析扫描来分析该样品离子。...
基于多结构比对的跨图建模的三维RNA逆折叠方法
一种基于多结构比对的跨图建模的三维RNA逆折叠方法,在离线阶段将目标RNA结构与RNA结构数据库进行多结构比对得到最接近相似结构并经对齐处理后,从目标RNA结构中提取出节点和边特征后通过跨结构编码生成训练集,用于对序列解码器进行训练;在在线...
一种基于扩散矫正算法的空间组学数据处理方法及系统
本发明提出一种基于扩散矫正算法的空间组学数据处理方法及系统,基于空间组学数据分别构建spot空间图和基因共表达图,并确定spot空间图的拉普拉斯矩阵和基因共表达图的拉普拉斯矩阵;基于菲克定律的离散化扩散方程,利用spot空间图的拉普拉斯矩阵...
一种基于生物信息反馈的进化纳米机器人设计方法
本发明涉及一种基于生物信息反馈的进化纳米机器人设计方法,属于软体机器人、生物医学工程及进化计算交叉领域。旨在解决纳米机器人因结构/功能耦合复杂、依赖肿瘤先验信息、难以动态适应生物环境导致的早期微小肿瘤无法自主识别与靶向问题。采用多目标进化算...
一种基于三维堆叠空间转录组数据虚拟器官模拟方法及系统
本申请提供了一种基于三维堆叠空间转录组数据虚拟器官模拟方法及系统,该方法包括:根据若干空间转录组切片数据的坐标信息构建空间邻接网络;采用图注意力自编码器对空间邻接网络中每个点位进行表达嵌入表示学习;对各切片的三维坐标进行体素化处理,通过高斯...
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