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一种高尿酸血症器官芯片模型的代谢模拟方法及系统
本申请涉及器官芯片模型技术领域,公开了一种高尿酸血症器官芯片模型的代谢模拟方法及系统,方法包括:采集器官芯片模型内的多个生理参数;根据当前运算规则,预测下游器官单元的生理功能状态数据和循环介质中的代谢产物浓度数据的预测值,并分别将下游器官单...
一种基于转移熵和隐马尔可夫模型的蛋白质变构路径识别方法
本发明为一种基于转移熵和隐马尔可夫模型的蛋白质变构路径识别方法AlloPath,属于生物信息学与蛋白质结构分析技术领域。该方法包括四个步骤:首先,针对目标蛋白质构建高斯网络模型(GNM);其次,通过高斯网络模型计算残基间的转移熵(TE),以...
数据处理方法、任务平台
本说明书实施例提供数据处理方法、任务平台,其中所述数据处理方法包括:获取待筛选配体和目标蛋白质构象;确定所述目标蛋白质构象对应的至少一个结合通道;计算各结合通道与所述待筛选配体对应的通道能量信息,获取各结合通道对应的通道属性信息;根据各结合...
一种构建靶向α放射性核素药物的药代动力学模型的方法和装置
本申请涉及剂量学技术领域,特别涉及一种构建靶向α放射性核素药物的药代动力学模型的方法与预测放射性核素给药剂量的装置,其中,方法包括:在多个时间点,针对多个受试者,获取替代核素的核医学成像结果,基于核医学成像结果,构建针对母核素的包括多个隔室...
基于不同稻区稻瘟病菌群的有效抗病基因预测方法
本发明涉及生物信息技术领域,具体涉及基于不同稻区稻瘟病菌群的有效抗病基因预测方法。该方法对不同稻区中不同品种稻株分析,通过被包含不同异常无毒基因类型菌株感染的情况分析扩张感染能力,结合历史数据分析所有异常无毒基因对应菌株对所在稻区的病害扩张...
一种MICP功能基因调控网络解析方法、装置、设备及介质
本发明涉及生物信息学技术领域,公开一种MICP功能基因调控网络解析方法、装置、设备及介质,本方案将MICP功能基因的表达数据二值化并映射为一维有序序列;其次,将基因状态序列编码为量子态向量,并利用矩阵乘积态张量网络对其进行高效压缩表示;在此...
预测动物样本祖先血统和品种纯度的计算机装置、方法及应用
本发明公开了预测动物样本祖先血统和品种纯度的计算机装置、方法及应用。本发明从地方猪品种中通过筛选获得了用于预测猪品种的特征SNP标记位点,基于这些位点通过使用机器算法构建预测待测猪的品种的预测模型,通过模型可预测待测猪是否属于已知猪品种,对...
一种用于猪品种资源精准鉴定的计算机装置和遗传标记组合及其应用
本发明公开了一种用于猪品种资源精准鉴定的计算机装置和遗传标记组合及其应用。本发明从地方猪品种中通过筛选获得了用于预测猪品种的特征SNP标记位点和153个最小子集SNP位点,基于这些位点通过使用机器算法构建预测待测猪的品种的预测模型,通过在预...
基于深度学习的猪全基因组低密度SNP芯片开发方法
本发明涉及生物信息学技术领域,且公开了基于深度学习的猪全基因组低密度 SNP 芯片开发方法,包括以下步骤:(1)进行 50K 芯片测序,以检测不同品种群体的基因型;(2)对群体样本的基因型和表型数据进行系统的整理和统计分析;(3)对群体检测...
一种多基因突变的肿瘤新抗原多肽算法
本发明公开一种多基因突变的肿瘤新抗原多肽算法,该发生突变的抗原靶点,具体位点是基因APRT p.E141V, KCTD10 p.Y172N, PABPC1 p.L218V, ADAM28 p.C315G, ARF3 p.G6V, KLHL2...
单细胞转录数据分析方法、装置及非易失性存储介质
本申请公开了一种单细胞转录数据分析方法、装置及非易失性存储介质。其中,该方法包括:采用各个备选模型对应的数据预处理方式对初始数据进行处理,得到各个备选模型所需的输入数据;依据各个备选模型对应的加载类来读取各个备选模型的模型配置信息,从而加载...
基于单细胞转录组数据推测可变剪接功能的方法和装置
本申请涉及生物信息学领域。具体地,本申请涉及基于单细胞转录组数据推测可变剪接功能的方法和装置。该方法包括:确定数据集中每个基因在细胞中的可变剪接模式;确定可变剪接模式和每个基因的基因表达之间的关联关系;根据可变剪接模式和基因表达之间的关联关...
一种毛细管长片段测序数据质量修正方法
本发明公开了一种毛细管长片段测序数据质量修正方法,针对现有技术中峰边界识别僵化、质量值校正维度单一、长片段测序适应性差及缺乏可视化验证的核心缺陷,通过动态识别峰边界解决峰形参数计算不准确的问题,通过整合半高宽、对称性、干扰程度等多维度峰形特...
多组学数据整合的肿瘤早期诊断分子标志物筛选方法
本发明公开了多组学数据整合的肿瘤早期诊断分子标志物筛选方法,属于生物医学技术领域。该方法包括样本收集与多组学数据获取、数据预处理与标准化、多组学数据分层整合、核心标志物筛选及多维度递进式验证五个步骤。通过“功能导向‑调控网络引导‑异质性适配...
基于深度学习的可解释DNA序列基序提取与可视化方法
本发明属于深度学习技术领域,具体涉及基于深度学习的可解释DNA序列基序提取与可视化方法,基于数据集AGCT背景构造的基线输入与DeepLIFT归因相结合的motif提取方法;将目标motif长度参数化为归一化截止频率并通过可调低通滤波实现长...
山羊品种鉴定芯片位点筛选系统及方法
本发明涉及品种鉴定技术领域,尤其涉及山羊品种鉴定芯片位点筛选系统及方法,该方法的步骤包括:获取监测区域内目标山羊品种和参照山羊品种的性状特征数据,同步获取监测区域内的环境特征数据;基于性状特征数据分析不同性状特征的生长趋势,评估目标山羊品种...
育种群体多性状综合选择指数计算平台
本发明公开了育种群体多性状综合选择指数计算平台,涉及作物遗传育种技术领域,包括:数据获取模块收集实时表型数据流与历史年龄序列数据。模型拟合模块利用历史数据拟合初始年龄动态模型;偏离计算模块通过计算标准化残差,量化实时数据与模型预测的偏离程度...
一种植物着丝粒识别与边界界定方法
本发明属于生物信息技术领域,公开了一种植物着丝粒识别与边界界定方法,具体步骤包括:对CENH3 ChIP‑seq原始测序数据进行质量控制;将质控后的reads比对至目标植物参考基因组,文件转换后按预设窗口计算每个bin的平均覆盖度或ChIP...
基于全长转录组测序的肿瘤新抗原预测方法、系统、电子设备及存储介质
本发明公开了一种基于全长转录组测序的肿瘤新抗原预测方法、系统、电子设备及存储介质,包括:对肿瘤组织和正常对照组织进行全长转录组测序,并进行转录注释,得到肿瘤特异性转录本集合;对肿瘤特异性转录本进行单碱基分辨率分析,识别肿瘤细胞的突变信息;排...
基于DNA检测的目标病原细菌免疫抗体检测方法
本发明涉及生物检测技术领域,公开了基于DNA检测的目标病原细菌免疫抗体检测方法。该方法包括获取待测生物样本的目标病原细菌DNA序列数据和免疫抗体蛋白表达量数据;对目标病原细菌DNA序列数据进行突变位点扫描,识别高频突变区域边界并计算序列突变...
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