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DNA框架纳米结构的区域结构稳定性分析方法
本发明提供了一种DNA框架纳米结构(DFN)的区域结构稳定性分析方法。具体地,所述方法包括构建DFN来模拟体内的高度折叠的DNA结构,通过诱导DFN损伤,并对DFN损伤后不同时间点的反应中间体进行结构分析,获得损伤过程的动态结构变化,从而分...
一种特异性识别三氯蔗糖的环肽及其计算机辅助优化设计方法
本发明提供一种特异性识别三氯蔗糖的环肽及其计算机辅助优化设计方法,通过计算机模拟和分子对接、分子动力学、深度学习等技术,以分子对接评分与分子动力学模拟的结合自由能为判断依据,在无需湿试验的情况下,快速高效设计对目标小分子如三氯蔗糖具有高亲和...
蛋白质序列的预测方法、模型训练方法、一种任务平台
本说明书实施例提供蛋白质序列的预测方法、模型训练方法、一种任务平台,其中蛋白质序列的预测方法,包括:获取待处理蛋白质结构信息;根据所述待处理蛋白质结构信息生成对应的初始蛋白质序列;基于预设预测次数将所述初始蛋白质序列输入至序列迭代去噪模型,...
一种基于大语言模型的环肽三维结构预测方法
本发明提供了一种基于大语言模型的环肽三维结构预测方法,属于人工智能与计算生物学交叉技术领域。该方法将预测流程划分为序列语义解析与空间结构生成两个阶段:在序列语义解析阶段,利用预训练大语言模型对环肽氨基酸序列及结构标注信息进行深度语义理解,精...
一种基于能垒拓扑理论的生物大分子结合效能评价方法、装置及系统
本发明公开了一种基于能垒拓扑理论的生物大分子结合效能评价方法。通过引入动态权重因子α, β修正环境动力学干扰,构建了林远哲指数(LYI)评价算子。该算子量化了物理吸附相能级(ΔG_adhesion)与化学锁定相能级(ΔG_locking)的...
单细胞转录组联合孟德尔随机化鉴定COPD靶点RUNX2的方法
本发明公开了单细胞转录组联合孟德尔随机化鉴定 COPD 靶点 RUNX2的方法包括单细胞数据分析和孟德尔随机化分析验证两个步骤;其中单细胞数据分析又分为:数据获取与预处理,包括:数据质控→整合→归一化→降维→聚类;细胞类型注释;RUNX2差...
基于解耦式多模态基础模型与轻量适配的空间域划分方法
本发明请求保护基于解耦式多模态基础模型与轻量适配的空间域划分方法,其包括以下步骤:无监督的多模态表征基础模型构建步骤;对输入的基因表达、空间位置和形态图像数据进行预处理,基于空间坐标构建空间邻域图;通过数据自驱动的非对称多模态交叉注意力融合...
基于多维相似度加权融合的母乳乳脂肪球膜蛋白模拟度评价方法
本发明公开一种基于多维相似度加权融合的母乳乳脂肪球膜蛋白模拟度评价方法,所述方法包括:构建母乳MFGM蛋白组学数据库,并获取待评价样本的蛋白组学数据;基于母乳MFGM蛋白组学数据库,通过行筛选和列筛选得到参考矩阵,对参考矩阵进行对数变换,计...
全基因组选择的样本数据扩充方法、装置、设备及介质
本申请公开了一种全基因组选择的样本数据扩充方法、装置、设备及介质,该全基因组选择的样本数据扩充方法包括:获取目标农作物在历史作物育种过程中的真实基因型数据以及真实基因型数据对应的表型数据,并根据所述真实基因型数据和所述表型数据生成初始样本集...
一种基于scRNA-seq的肿瘤类器官生产及批次验证系统与方法
本发明公开了一种基于scRNA‑seq的肿瘤类器官生产及批次验证系统及方法,涉及生物技术领域,旨在解决类器官培养批次变异大、验证不精准的技术问题。系统包括类器官培养模块与图谱验证模块,类器官培养模块提供三维培养环境并执行参数自动调整,图谱验...
一种整合基因组注释信息提升基因组选择准确性的方法
本发明公开了一种整合基因组注释信息提升基因组选择准确性的方法,属于分子育种技术领域。本发明方法包括:构建参考群体并精准测定目标性状;利用全基因组重测序技术获取高密度基因型数据;构建包含基因结构、编码区密码子简并性、核苷酸多样性等多维信息的S...
适用于纳米孔基因测序原始数据实时处理的方法和系统
公开了一种适用于纳米孔基因测序原始数据实时处理的方法和系统,可以将获取的基因测序原始数据进行预处理和转矩,以将数据转化成连续的可指定长度的单纳米孔数据结构。然后,对预处理和转矩后的数据进行压缩,以剔除无效数据。这样设计的数据处理方法以及配合...
一种基于纳米孔直接RNA测序技术分析水生环境中RNA病毒的方法及系统
本发明公开了一种基于纳米孔直接RNA测序技术分析水生环境中RNA病毒的方法及系统。本发明通过筛选RNA病毒组装工具和注释工具,开发了一种基于纳米孔RNA测序(NDRS)准确分析水生环境RNA病毒的方法及系统,为水生环境中的RNA病毒检测提供...
一种基于多层次序列约束的核心启动子智能设计方法
本公开涉及一种基于多层次序列约束的核心启动子智能设计方法,包括:获取原始核心启动子序列集合;通过训练好的目标模型,对原始核心启动子序列集合进行处理,生成候选核心启动子序列集合,并基于多层次序列约束从候选核心启动子序列集合中筛选出目标核心启动...
一种单细胞时间序列数据模拟与补全方法及系统
本发明属于单细胞数据处理技术领域,尤其涉及一种单细胞时间序列数据模拟与补全方法及系统。该方法包括以下步骤:通过对时间起点、终点单细胞矩阵变分自编码器(VAE)模型中隐空间向量表示进行插值,进而在隐空间内对这两个向量进行插值,生成中间时间点隐...
一种基于分层过滤和自适应参数优化的并行精确局部序列比对方法
一种基于分层过滤和自适应参数优化的并行精确局部序列比对方法,属于生物学技术领域。为了解决现有局部比对领域技术不能兼顾速度与精确性度的问题。本发明建立一个包含假阳性率和假阴性率的概率模型,并得到总成本,基于用户的比对要求确定使总成本最小的最优...
一种基于k有界匹配统计的DNA序列局部比对方法
一种基于k有界匹配统计的DNA序列局部比对方法,本发明为解决现有DNA序列比对方法在处理大规模基因组数据时速度、灵敏度、坐标信息保留、资源消耗均存在内在矛盾和局限性,导致比对慢、限制下游应用和资源占用多的问题。本发明利用谱图Burrows‑...
一种基于系统发育信息和配对编辑距离的着丝粒序列比对方法
本发明涉及一种基于系统发育信息和配对编辑距离的着丝粒序列比对方法,属于着丝粒序列比对技术领域。本发明提供的算法利用卫星序列的系统发育信息和配对编辑距离来构建共线性关系。本发明首先采用保守选择的方式,逐步增加编辑距离(ED)阈值,直至两条序列...
一种伪时序流形对齐与图注意力的细胞动力学预测方法
本发明公开了一种伪时序流形对齐与图注意力的细胞动力学预测方法,属于新一代信息技术中生物信息学与人工智能交叉技术领域。首先获取单细胞转录组数据,处理得到基于伪时序轨迹有序排列的单细胞转录组特征矩阵,同时获取在多个离散临床时间点的批量转录组数据...
一种单倍型感知的序列到图比对方法、系统、装置、介质
本发明属于基因序列比对技术领域,具体涉及一种单倍型感知的序列到图比对方法、系统、装置、介质,该方法将单倍型信息直接嵌入到泛基因组图的边关联结构中,使图结构本身具备表达单倍型路径的能力。然后采用改进的单倍型感知偏序比对算法将序列映射到该图上,...
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