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  • 本发明公开了一种伪时序流形对齐与图注意力的细胞动力学预测方法,属于新一代信息技术中生物信息学与人工智能交叉技术领域。首先获取单细胞转录组数据,处理得到基于伪时序轨迹有序排列的单细胞转录组特征矩阵,同时获取在多个离散临床时间点的批量转录组数据...
  • 本发明属于基因序列比对技术领域,具体涉及一种单倍型感知的序列到图比对方法、系统、装置、介质,该方法将单倍型信息直接嵌入到泛基因组图的边关联结构中,使图结构本身具备表达单倍型路径的能力。然后采用改进的单倍型感知偏序比对算法将序列映射到该图上,...
  • 本发明公开了一种基于CRISPR‑Cas12a的质粒池DNA数据库管理方法及系统,包括以下步骤:S1、数据写入:对用户需要存储的数据进行编码,将编码后的DNA序列与设计的多层地址序列组装成质粒图谱,经合成、克隆后形成质粒池数据库;S2、数据...
  • 本发明涉及基因组学和微生物科学技术领域,特别是涉及一种黏菌T2T基因组组装方法。该组装方法主要包括四个步骤:全局组装,端粒序列筛选,局部序列聚类筛选,二代数据多轮校正。本发明提供的方法新增了端粒序列筛选和局部序列聚类筛选的污染去除策略,有效...
  • 本申请提供一种微生物群落的丰度轨迹预测方法、装置、设备及介质,涉及生物信息技术领域,其中方法包括:获取第一生产班组的多个发酵体对应的至少一个目标丰度时间序列;目标丰度时间序列包含目标微生物类群在完整发酵阶段按发酵时间排序的丰度数据;对每个目...
  • 本发明属于基因技术领域,公开了一种利用双层优化检验挖掘关联基因及调控途径的方法,本发明RADAR解决了机器学习预测过程的黑箱子问题,提供了生物学机制解释。之前的研究多是利用多组学数据预测表型,但是机器学习的方式难以真实评估基因的作用大小以及...
  • 本申请公开了一种宏基因组分类方法及系统,该方法包括:生成l‑mer序列并建立其与生物学语义得分的映射表;获取参考基因组序列的集合;以窗口沿预设步长在参考基因组序列上滑动,截取每个窗口内的序列片段;对每个窗口执行特征提取操作;将特征的64位整...
  • 本发明公开AI辅助蛋白质纯化结果分析方法及系统,方法包括S1,进行色谱图数据、电泳图像数据和质谱峰表数据的采集;S2,在获得色谱图数据、电泳图像数据和质谱峰表数据后进行数据预处理;S3,将预处理后的数据通过AI识别分析实现电泳条带识别、色谱...
  • 本发明公开了一种基于双向生成模型的番茄育种预测与设计方法。该方法首先构建番茄基因型与表型综合数据集,利用注意力机制进行特征关联分析;随后构建包含正向预测与反向设计通路的双向深度学习模型。正向网络采用自注意力机制从基因型精准预测表型,反向网络...
  • 本发明属于多致病菌入侵机制对比分析方法技术领域,尤其涉及多维数据协同融合的多致病菌入侵机制对比分析方法,对基因组、转录组、蛋白组多源异构数据采用组合标准化方法消除噪声与尺度差异,通过生物信息学工具提取对应基础特征,整合构建多模态原始特征库;...
  • 本申请涉及生物信息学和代谢组学,公开了一种人组织脂质代谢组学多维度统计分析方法、设备、介质及产品。包括:获取质谱检测原始数据进行预处理,得到脂质定量数据集;基于脂质定量数据集,得到第一差异代谢物候选集合;基于显著性参数和特征重要度确定含量变...
  • 本发明提供了一种在单细胞微生物基因组中批量检测病毒的方法。该方法通过构建综合参考索引、独立参考索引并结合两级检测策略,实现了高通量、批量化和自动化分析,一次运行即可同时检测样本中是否存在数据库内所有病毒/质粒,并自动完成与所有菌株的关联性分...
  • 本发明公开了一种基于空间多组学数据的目标代谢物跨细胞传输量化方法和。所述方法包括:获取包含代谢物丰度、空间坐标和细胞类型注释的空间多组学数据;基于预设的供方和需方细胞类型筛选位点;提取目标代谢物在对应位点上的丰度;基于空间坐标构建供方‑需方...
  • 本发明提供了一种口腔关键微生物高糖微环境下的单菌株代谢特征图谱数据库及其构建方法和应用,属于口腔微生物学技术领域。本发明在体外模拟口内高糖微环境条件下,对口腔关键微生物进行标准化单菌株培养、培养上清全谱代谢检测(非靶向液相色谱‑质谱LC‑M...
  • 本申请涉及DNA数据存储技术领域,特别涉及一种基于二级结构指纹分离存储的DNA信息加密纠错方法,包括:信息DNA编码阶段、结构签名生成阶段、签名DNA编码阶段、信息DNA与签名DNA合成阶段以及解码与纠错阶段;信息DNA编码阶段用于将原始数...
  • 本发明涉及分子电子结构计算技术领域,提供了一种双原子分子的电子结构计算方法及系统,包括:基于双原子分子的结构和电子态性质,通过求解电子的薛定谔方程得到中程势能曲线和偶极矩,通过微扰理论计算得到全程势能曲线;其中,在求解电子的薛定谔方程时,原...
  • 本发明为一种基于分子动力学的沥青高温裂解碳排放行为模拟方法,属于道路工程材料技术领域,解决现有分子动力学模拟多采用单一恒定温度实验方案,难以反映沥青在施工全过程中动态温度变化导致的裂解反应演变问题。本发明首先在Materials Studi...
  • 本发明涉及工业水处理技术领域,尤其涉及一种循环水中镁离子难结晶机理的分子动力学模拟方法、装置、设备及计算机可读存储介质,其中,方法包括:基于方解石或石膏的特定晶面作为结晶基底,构建初始模拟体系;对初始模拟体系进行分子动力学模拟,记录模拟过程...
  • 本发明公开了一种分子动力学仿真方法、装置、设备和存储介质,包括:在进行分子动力学等温等压系综仿真过程中,执行针对格点的三维卷积计算;根据三维格点坐标确定在计算三维的卷积因子时所需使用的目标浮点数;计算与目标浮点数对应的定点数格点因子,并将定...
  • 本发明涉及计算化学技术领域,具体涉及一种渗透性预测模型的构建方法、化合物筛选方法及电子设备,其中渗透性预测模型的构建方法包括:利用包含基础描述符的第一数据集训练初筛模型,利用包含机理描述符的第二数据集训练诊断模型,将初筛模型和诊断模型进行关...
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