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  • 本申请提供了融合迁移学习与可解释机制的性状遗传变异位点预测方法,包括:基于双通道特征编码策略从DNA序列中提取多维特征,构建序列特征的张量结构;构建用于建模SNP与性状间复杂关系的深度学习网络模型,在深度学习网络模型中,采用多层卷积、三域分...
  • 本发明公开了一种蛋白质‑配体结合位点与亲和力预测方法及系统,属于生物信息学与计算机深度学习技术领域。方法包括:采集并处理蛋白质的PDB格式文件以及配体的SDF格式文件,得到批处理后图数据张量;构建复合型编码器,将所述批处理后图数据张量输入至...
  • 本公开提供一种蛋白质语言模型预训练与蛋白质突变方法及相关产品。该蛋白质语言模型预训练方法的一具体实施方式通过获取样本蛋白质数据集合;再根据每个该样本蛋白质数据中的多序列比对在各个位点的氨基酸残基概率分布,生成该样本蛋白质数据对应的多序列比对...
  • 本发明公开了基于纳米孔测序与智能判读的病原微生物检测系统,该系统包括生物分子电信号采集模块、病原特征序列提取模块等六个模块。通过纳米孔芯片阵列采集离子电流变化信号,经差分编码提取病原特征序列,利用超图拓扑结构自适应构建模块建立病原关系模型,...
  • 本发明提供一种样本特异性基因调控网络预测方法、装置、设备及存储介质,涉及人工智能领域,该方法包括:获取m个样本对应的调控因子与靶基因的双重表达数据;将双重表达数据作为输入数据,以最小化输入数据的重建误差为目标,对预设模型进行训练,得到目标模...
  • 本发明公开了基于集成机器学习的实体肿瘤紫杉烷/免疫治疗响应评估系统及其工作方法,属于生物信息学及人工智能交叉技术领域。步骤1:对获取的实体瘤紫杉烷化疗/免疫治疗响应转录组数据或源数据集进行预处理,并进行训练集与验证集的划分;步骤2:基于预处...
  • 本公开提供一种核酸检测结果评估方法和装置、存储介质。核酸检测结果评估方法包括:获取核酸循环扩增反应中的N个原始荧光数值;预处理N个原始荧光数值,以得到N个待处理荧光数值,其中N个待处理荧光数值中的每个待处理荧光数值在预定范围内;根据第i次循...
  • 本发明公开了一种基于多维证据链评分的肿瘤新抗原精准分析方法及系统,涉及生物信息学、计算生物学和肿瘤免疫学交叉技术领域,包括:多维证据链评分模块,用于评估候选新抗原的可行度得分;抗原提取与验证模块,用于根据可行度得分识别和验证肿瘤特异性抗原;...
  • 本公开涉及一种针对多肽序列的评估方法及装置。涉及多肽检测技术领域,该方法包括:检测出待评估样本中各待检蛋白质的检测多肽序列集合及其含量;基于预设序列相似度算法、各检测多肽序列的含量、参考样本对应的目标多肽序列集合中的目标多肽序列的含量和零分...
  • 本发明公开了一种基因组展示和分析系统,所述系统包括基因组信息及文献信息获取模块,基因展示模块,基因对比模块,引物设计模块,根据本发明方法建立的数据库,具有快速获得不同物种间的相似同源基因、实现更精准快速对比分析不同物种间的基因或蛋白质序列、...
  • 本发明公开了一种基于互信息的差异基因调控网络重构方法及冗余调控滤除系统。该方法首先采集两个或多个条件下的基因表达数据,分别计算各条件下的基因对互信息,筛选互信息差异显著的基因对作为候选调控边。进一步,通过计算条件互信息识别并剔除中介变量导致...
  • 本申请提供一种对空间转录组学数据进行多尺度建模的方法及装置,涉及生物信息技术领域,该方法包括:获取待处理的空间转录组学ST切片,并对ST切片进行多尺度信息提取,得到多个待处理子切片;将多个待处理子切片中每个待处理子切片所对应的待处理信息依次...
  • 本申请涉及生物信息管理技术领域,尤其是涉及一种基于图卷积神经网络的轻量级抗菌肽挖掘系统及方法。针对传统方法周期长、成本高、模型泛化性差等问题,通过构建图卷积网络、提取理化特征、嵌入3D结构信息并融合,结合焦点损失函数解决样本不平衡,实现端到...
  • 本发明实施例涉及一种基于多路复用异构图神经网络的癌症基因识别方法,包括:对于癌症异构图网络中的每个节点的初始特征进行更新,输出更新后的特征;据此生成对应的节点嵌入字典;节点嵌入字典包括癌症异构图网络中每个节点在不同关系子图下经过学习后的嵌入...
  • 本发明涉及双水平‑图约束对比学习的单细胞RNA测序数据聚类方法,属于生物信息领域。针对scRNA‑seq数据固有的高维性和稀疏性造成的表征学习困难问题,本发明包括:对scRNA‑seq数据进行数据预处理,并通过松鼠搜索优化算法筛选关键基因;...
  • 本申请提供基于机器学习的甘薯淀粉酶含量分析方法与系统,包括:根据去噪后的时序序列构建三维状态空间矩阵,采用模糊隶属度函数对温度梯度、酸碱度波动、时间累积量和深度位移量进行归一化映射,得到标准化状态向量;通过实验室酶标仪测定不同状态向量下的淀...
  • 本申请提出一种基于H&E染色病理图像的基因表达预测方法及系统。方法包括:构建训练集;将病理图像样本集输入初始基因表达预测模型,输出图像融合特征及基因表达预测值;利用对比学习模型得到图像投影特征,将基因表达真实值编码后投影在潜空间中得到基因表...
  • 本发明提供一种代谢产物的产量预测方法、装置、设备及介质,涉及数据处理技术领域,其中方法包括:获取目标菌株的特征集;特征集是基于目标菌株的所有k‑mer序列中,与目标代谢产物正相关的k‑mer序列以及与目标代谢产物负相关的k‑mer序列构建的...
  • 本发明公开了生物信息学领域中预测非模式生物必需基因的数据处理装置及方法与应用。本发明所要解决的技术问题是如何筛选非模式生物的必需基因。本发明将目标物种的蛋白质序列和n种模式生物物种的蛋白质序列分别基于注释得到每种蛋白对应的标签;然后将蛋白质...
  • 本发明公开一种基于DNA分子的支持向量机SVM结构,包括依次级联的加权求和模块、减法模块、信号恢复模块和输出模块,加权求和模块将权重映射为两种不同DNA复合物浓度的比值,先对多个变量分别执行加权操作,再统一执行求和操作,产生正加权输出信号和...
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