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  • 本发明公开了多空间自监督对比学习的空间转录组数据空间域识别方法,包括:建模生成空间邻域图,保持图结构不变,打乱节点特征进行数据增强,作为增强图;基于图神经网络构建编码器,对融合了空间信息与基因信息的空间转录组数据进行提取得到潜在嵌入,送入多...
  • 本发明公开一种基于反绎学习和基因知识本体的基因表达预测方法,旨在解决传统基因表达预测方法中数据需求量大、可解释性差的问题。通过结合反绎学习和基因知识本体,构建基因表达预测模型。从公共数据库中获取基因表达数据,并进行数据预处理和重要性特征提取...
  • 本发明公开了一种融合多环境因子的玉米遗传表现预测方法,包括:获取亲本基因型数据矩阵、杂交种表型数据向量和多环境时序气候数据张量;构建气候滞后效应矩阵,量化不同气候因子对玉米生长发育的滞后影响程度;构建环境时空关系矩阵和考虑区段不均等贡献的增...
  • 本发明公开了基于耐药序列测定的H IV‑1感染者治疗前耐药分析系统,属于医学检测技术领域。基于耐药序列测定的HIV‑1感染者治疗前耐药分析系统,包括样本采集与处理模块、耐药序列测定模块、耐药序列分析模块、耐药表型预测模块和治疗方案推荐模块。...
  • 本发明公开了一种基于BERT模型的密码子优化方法及系统,所属领域为生物信息学与基因工程的交叉技术领域,该方法包括:在特定物种的基因组上训练BERT模型;利用模型中的多头自注意力机制,提取基因组序列的上下文语义特征;通过模型输出解析密码子之间...
  • 本发明涉及蛋白质预测技术领域,特别涉及一种基于几何深度学习的蛋白质结合位点预测方法。本发明引入蛋白质几何描述及对应的几何图学习方案,为建模三维结构特征提供了可行途径;此外,还提出了一种RSA引导两阶段的混合迁移学习策略,首先在更大数据集上训...
  • 本发明涉及生物信息学和基因组学技术领域,具体涉及超低测序深度的基因组缺失区间检测方法。包括:步骤一、获取测序读段并进行质量控制,计算获得参考基因组中每个位点的测序深度;步骤二、基于每个位点的测序深度,计算获得每个bin的平均测序深度;步骤三...
  • 本发明公开一种B细胞表位预测方法、系统、设备及介质。该方法获取待检测的抗原序列;将抗原序列分别输入至ESM‑C模型和AlphaFold3模型,获得ESM‑C嵌入表示和三维预测结构;所述三维预测结构通过ESM‑IF1逆折叠模型和DSSP算法进...
  • 本申请公开了一种测序报告的生成方法、装置、电子设备及存储介质,应用于计算机设备,方法包括:计算机设备获取待分析的测序结果数据;计算机设备对待分析的测序结果数据进行解析,获取基因变异标识信息,并根据基因变异标识信息生成查询标签;计算机设备根据...
  • 本申请提供基于变异体适应性的季节性流感病毒疫苗株推荐方法及系统包括:获取从当前流感季起近三个流感季的流感病毒血凝素蛋白HA序列数据和流感阳性率数据;识别HA蛋白序列的每个位点上的氨基酸突变,筛选下一流感季的风险突变;在当前流感季的HA蛋白序...
  • 本发明涉及药物靶标预测技术领域,公开了一种药物靶标智能预测方法及系统,药物靶标智能预测方法包括以下步骤:步骤1:获取目标蛋白质的结构数据和序列数据以及目标蛋白质的同源序列数据;步骤2:根据结构数据进行分子动力学模拟,计算得到动态构象特征向量...
  • 一种双流协同注意力与稀疏特征融合的药物‑靶标相互作用预测方法,它属于计算生物学技术领域。本发明解决了现有方法无法捕捉子结构判别特征以及药物‑靶标相互作用对的关键结合区域特征的问题。本发明采用结合多尺度空间注意力机制与通道增强注意力机制的双流...
  • 本申请公开了一种药品配伍有效成分分析方法,涉及药品配伍技术领域,本申请包括基于预获取的患者基础信息和中药处方数据,进行数据整合以生成综合数据集,在预设的统一成分数据库提取有效成分以生成成分列表,通过预设的靶点映射分析作用靶点以生成靶点矩阵;...
  • 本发明公开一种基于KAN网络的分子对接评分函数优化方法及系统,属于人工智能药物发现技术领域;一种基于KAN网络的分子对接评分函数优化方法包括:从公共数据库中收集分子对接数据;预处理分子对接数据,提取分子bSASA特征和分子Vina特征;基于...
  • 本发明公开了生物标志物CCT7的食管癌诊断和治疗中的应用,包括:采集受试者食管组织样本及临床表征参数,检测CCT7基因及蛋白表达水平,结合EGIC分型模型参数输入图神经网络药物‑靶点模型,经图卷积操作生成特征矩阵,构建多维度特征空间,筛选关...
  • 本发明公开了基于度量学习的药物靶点的预测方法及系统,所述预测方法结合了度量学习来训练模型,使得相同靶点活性的分子在化学中接近,不同靶点活性的分子在化学空间中远离,实现“同类内聚,类外分离”的效果。避免了基于相似性方法通过结构相似间接关联活性...
  • 本发明公开了一种分析瓜蒌薤白半夏汤治疗心力衰竭(心衰)作用机制的方法,通过整合网络药理学与代谢组学技术,系统解析该方剂的多成分、多靶点、多通路协同作用机制。该方法为中药复方治疗复杂疾病的机制研究提供了系统化分析策略。
  • 本发明提供一种依据毒理学优先级指数对地表水体中有机硅类新污染物的排序方法,属于环境毒理学和生态风险评估技术领域,通过综合浓度、检出率,降解半衰期、毒性参数、分子对接分析获得的结合能及迁移能力等多维度指标,构建毒理学优先级指数(ToxPi),...
  • 本发明公开了生物信息学与计算机药物设计技术领域的一种蛋白质语言模型靶向多肽生成方法及系统。该蛋白质语言模型靶向多肽生成方法包括以下步骤:输入模块读取原始序列数据作为联合输入;嵌入模块将原始序列数据转换成嵌入向量数据;编码器模块采用ESM3模...
  • 本发明公开了人工智能辅助生物医药技术领域的基于功能提示的治疗性多肽生成方法及系统。该基于功能提示的治疗性多肽生成方法利用抗菌肽和抗癌肽之间的生物学关联,引入功能提示标签硬标签对ProGen2蛋白质语言模型进行提示式微调,采用AMP和ACP联...
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